مقايسه بيوانفورماتيكي بين شاخص هاي ترجيح كدوني ژن هاي رمز كننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگين ( P1B-ATPase ) بين گياهان و باكتري هاي مختلف

به منظور بررسي و مقايسه شاخص هاي ترجيح كدوني ژن هاي رمز كننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگين(p1B-ATPase) در گياهان و باكتري هاي مختلف توالي نوكلئوتيدي ژن هاي مزبور از بانك اطلاعاتي EBI گرفته شد و از نظر شاخص هاي ترجيح كدوني توسط سايت codonw 4.1 مورد تجزيه و تحليل قرار گرفته و باهم مقايسه شدند. نتايج نشان داد كه اختلاف معني دار ي در سطح 5% بين شاخص هاي T3 ، CAI ، CBI ، FOP ، ENc ، L-Sym و L-aa وجود دارد. به طور كلي شاخص هاي مانند CAI و FOP در باكتري ها بيشتر از گياهان است كه نشان دهنده ميزان بيان بيشتر اين ژن در باكتري ها هست. همچنين مشاهده شد كه در گياهان T و G داراي بيشترين فراواني و در باكتري ها C و G داراي بيشترين فراواني در كدون انتهايي هستند. تفاوت بين گياهان و باكتري ها از نظر شاخص ENc نشان مي دهد كه باكتري ها داراي انحراف كدوني بيشتري نسبت به گياهان هستند كه مي تواند ناشي از محتواي CG3 بيشتر آن ها باشد كه داراي ضريب همبستگي مثبت تري نسبت به گياهان مي باشد.