كاربرد‌هاي NGS در مطالعه ميكرو ارگانيسم هاي دستگاه گوارش حيوانات

Next-generation sequencing applications in studying gut microbiota

ظهور توالي يابي نسل جديد(NGS) يا توالي يابي با توان عملياتي بالا تغييراتي اساسي در زمينه اكولوژي ميكروبي ايجاد كرده است و مطالعات زيست محيطي و ميكروبي را به سطح ديگري رسانده است. اين تكنولوژيها از لحاظ روش توالي‌يابي اسيد‌هاي نوكلئوئيك بشدت همسو، توان عملياتي بالا و هزينه كاهش يافته با روش سانگر متفاوت هستند. ميكروبيوتاي دستگاه گوارش يك اصطلاح مشترك براي ميكروارگانيسم‌هايي است كه در دستگاه گوارش زندگي مي‌كنند. اين ميكروبيوتا دستگاه گوارش تا حد زيادي با متابوليسم مواد مغذي و سيستم ايمني گونه‌هاي ميزبان مرتبط ميباشد و اين يك عامل مهم در حفظ سلامت ميزبان است. ارتباط ميكروبيوتا و ميزبان در دهه‌هاي اخير توجه تحقيقات را به خود اختصاص داده است. استفاده مداوم و دقيق‌تر از تكنولوژي توالي يابي نسل جديد (NGS) منجر به شناخت دقيق و جامع از ظرفيت عملكردي، رقابتي و فراواني نسبي تغييرات در جوامع ميكروبي خواهد شد. لذا كاربرد اين تكنولوژيهاي جديد براي شناخت عملكرد بهتر ميكروبيوتا در راستاي بهبود سلامت، ايمني و عملكرد ميزبان مي باشد.

advent of next-generation sequencing (NGS) or high-throughput sequencing has revolutionized the field of microbial ecology and brought classical environmental studies to another level. These technologies are different from the Sanger method in terms of massively parallel method of sequencing nucleic acids, high throughput, and reduced cost. The gut microbiota is a collective term for microorganisms that live in the digestive tracts. This microbiota is closely related to the nutritional metabolism and immune system of their host species, and an important factor in the maintenance of its health. Host–microbiota relationships have garnered increased research attention in recent decades. Continued and more precise use of next-generation sequencing (NGS) technologies will lead to a detailed and comprehensive understanding of compositional and functional capacity and relative abundance shifts in microbial populations. Therefore, the application of these new technologies is to the better characterize microbiota performance in order to improve host health, safety and performance