آنتولوژي ژن هاي هدف مرتبط با توليد شير شناسايي شده براي bta-miR183

The ontology of target genes associated with milk production identified for bta-miR183

شير به عنوان منبع عالي مواد مغذي شناخته شده است و ماده اوليه ساخت طيف وسيعي از محصولات لبني ميباشد. بنابراين متخصصان ژنتيك و اصلاح نژاد از طريق شناسايي فرايندهاي بيولوژيكي به دنبال افزايش اين محصول ميباشند، از جمله استراتژيهايي كه توليد شير تحت تأثير آن قرار دارد ميكرو RNA ها هستند. ميكرو RNA ها ملكول هاي RNA كوچك غير كد كننده است وحدود 23 - 17 نوكلئوتيد طول دارد. وظيفه اصلي آن تنظيم بيان ژن پس از رونويسي است. از نتايج بررسيهاي ژن آنتولوژي ميتوان در مورد شناسايي عملكرد ژن، و تفسير و ارزيابي نتايج خوشهبندي ژنها استفاده كرد. در مطالعه حاضر، به منظور بررسي نقش عملكردي bta-miR183 ، ژنهاي هدف اين ميكرو RNA توسط نرم-افزار آنلاين TargetScan پيشبيني شد. بعد از شناسايي ژنهاي هدف فرايند آناليز خوشهبندي ژنها صورت گرفت. اين فرايند خوشهبندي بر مبناي دانش بيولوژيكي استخراج شده از GO توسط نرم افزار agriGO انجام شد. تجزيه و تحليل ژن آنتولوژي نشان داد چندين فرايند بيولوژيكي كه بيشترين نقش روي توليد شير داشتند، مسير سيگنال دهي WNT ميباشد كه جزء مسيرهاي معنيدار شناخته شده در توليد شير است، فرايند بيولوژيكي ديگر توسعه ي ارگانها است كه شامل توسعه غده پستاني هم ميشود، مهمترين فعالي تهاي ملكولي شناخته شده در اين مطالعه فعاليت پروتئين كيناز است، نتايج آناليز هستي شناسي بر اساس اجزاي سلولي نشان داد كه بيشترين ژن ها با سطح معنيداري در بخش داخل سلولي قرار دارند.

Milk is known as a great source of nutrients and is the primary ingredient in the production of a wide range of dairy products. Therefore, geneticists and breeders will seek to increase this product by identifying biological processes. One of the strategies that milk production is affected are micro-RNAs. Micro RNAs small noncoding RNA molecules range from about 17-23 nucleotides long. Its main function is to regulate the gene expression after transcription. From the results of the gene ontology research, it is possible to identify the gene function, interpret and evaluate the clustering results of the genes. In the present study, to investigate the functional role of bta-miR183 the target genes of this micro-RNA were predicted by TargetScan software. After identification of the target genes the process of analysis of clustering of genes was performed. This clustering process was based on the biological knowledge extracted from GO by agriGO software. The ontological gene analysis revealed that several biological processes that had the most role in milk production were the WNT signaling pathway which is one of the known pathways in milk production, the biological process is the development of mammary gland, the most important molecular activity known in this study is protein kinase activity. The results of ontology analysis based on cellular components showed that most genes are located at the significant level in the intracellular region.