شناسايي واريانت‌هاي آللي ژن C4A گاوهاي هلشتاين با استفاده از تكنيك iPLEX

Identification of allelic variants of C4A gene in Holstein cows using the iPLEX technique

برنامه‌هاي به‌نژادي در جهت افزايش صفات توليدي باعث كاهش مقاومت حيوان به بيماري‌ها از جمله ورم پستان شده، بنابراين انتخاب مستقيم براي مقاومت به ورم پستان از طريق كاهش تعداد سلول‌هاي سوماتيك هدف بسيار مهمي است كه بايد براي بهبود توليد و كيفيت شير در نظر گرفته شود. در اين پژوهش شناسايي واريانت‌هاي آللي ژن C4A مرتبط با تعداد سلول‌هاي سوماتيك شير بررسي شد. به اين منظور از 384 راس گاو هلشتاين نمونه خون تهيه واستخراج DNA به روش نمكي بهينه يافته انجام شد. تعيين ژنوتيپ در دو جايگاه (rs137485678) و (rs132741478 ) ژن C4A بااستفاده از تكنيك iPLEX انجام شد. دو فرم‌ مختلف آللي C و G و سه ژنوتيپ CC، CG و GG در جايگاه (rs137485678) شناسايي شد كه بيشترين فراواني ژنوتيپي براي ژنوتيپ CG مشاهده شد، ولي در جايگاه (rs132741478 ) آلل يك شكل مشاهده شد. با بررسي مناطق بيشتري از اين ژن مي‌توان احتمالا از آن به عنوان نشانگر ژنتيكي در جهت كاهش تعداد سلول‌هاي سوماتيك و افزايش مقاومت به ورم پستان استفاده كرد.

Breeding programs to increase the production traits reduce animal resistance to diseases such as mastitis, so direct selection for mastitis resistance through reducing of somatic cells is a very important goal that must be considered to improve production and quality of milk. In this study, identification of allelic variants of C4A gene associated with milk somatic cell count was investigated. For this purpose, 384 blood samples were collected from Holstein cattle and DNA extraction was performed using optimized salting out method. Genotyping for two sites (rs137485678) and (rs132741478) of C4A gene was performed using iPLEX technique. that different Two forms of C and G alleles and three genotypes of CC, CG and GG were detected in SNP (rs137485678) C4A gene in Holstein cows. In marker site of rs137485678 the CG genotype showed the highest frequency , but in marker site of SNP (rs132741478) monomorph allele was observed. By studying more regions of this gene, it can probably be used as genetic markers to reduce the number of somatic cells and increase resistance to mastitis.