شناسايي چند شكلي‌هاي آللي جايگاه تك نوكلئوتيدي rs137805800 ژن SAA2 در گاوهاي هلشتاين در مازندران با تكنيك iPLEX

سرم آميلوئيد آ يك آپوليپوپروتئيني با وزن مولكولي 14 كيلو دالتون مي‌باشد، كه در پاسخ به التهاب و عفونت باكتريايي به سرعت توسط هپاتوسيت‌هاي كبدي توليد و آزاد مي‌گردد. هدف از پژوهش حاضر شناسايي چندشكلي‌‌ها‌ي آللي جايگاه rs137805800 در ژن‌SAA2 با تكنيك iPLEX در گاو‌هاي هلشتاين مازندران بود. به اين منظور، تعداد 384 نمونه خون از گاو‌هاي هلشتاين مركز شير و گوشت مهدشت از طريق وريد دمي با استفاده از ونوجكت حاوي EDTA جمع آوري شد. سپس نمونه‌هاي خون به آزمايشگاه ژنتيك مولكولي دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري منتقل و تا زمان استخراج DNA در دماي 20- درجه سانتي‌گراد نگه‌داري شدند. تعيين ژنوتيپ در جايگاه مورد نظر با تكنيك iPLEX انجام شده و اطلاعات مربوط به ژنوتيپ‌ها با نرم افزار POPGENE آناليز شدند. شاخص ني و ميانگين هتروزگوسيتي 20 درصد مشاهده شد. همچنين شاخص شانون 36 درصد بود كه نشان دهنده وجود تنوع ژنتيكي در اين نژاد است. با توجه به تاثير اين جايگاه بر صفات توليدي در گاوهاي شيري، انجام پروژه هاي بيشتر روي آن به عنوان يك ژن كانديد جديد پيشنهاد مي شود.

The amyloid serum is an apolipoprotein with a molecular weight of 14 kD, which is rapidly released by hepatocytes in response to inflammation and bacterial infection. The purpose of the present study was to identify allelic polymorphisms rs137805800 of SAA2 genes with iPLEX technique in Holstein cows in Mazandaran. For this end, 384 blood samples were collected from Holstein dairy cows of Mahdasht Milk and Meat Center from tail veins using EDTA containing venojects. Blood samples were transferred to Laboratory for Molecular Genetic, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University and stored at -20 ° C until DNA extraction. Genotyping of desired locus was performed using the iPLEX technique. The genotypes were analyzed by POPGENE software. The Nei index and average heterozygosity was observed at 21%. The Shannon information index was 36%, indicating the genetic variation in this breed. Given the effects of this gene on production traits in dairy cows, more studies are suggested on it as a new candidate gene.