شناسايي واريانت‌هاي آللي ژن CDKN1A مرتبط با صفات توليدي در گاو‌هاي هلشتاين

Identification of allelic variants of CDKN1A gene associated with production traits in Holstein cattle

ژن CDKN1A (ممانعت كننده‌ي كيناز A1 وابسته به سايكلين)، اثرات ژنتيكي زيادي روي درصد پروتئين و ديگر صفات توليدي در گاو دارد. هدف از پژوهش حاضر شناسايي واريانت هاي آللي در جهش‌هاي تك نوكلئوتيدي ژن‌ CDKN1A گاوهاي هلشتاين بود. خونگيري از 384 راس گاو‌هاي شيري انجام و استخراج DNA به روش نمكي بهينه شده صورت گرفت. نمونه‌هاي DNA حاصله با روش الكترفورز روي ژل آگارز مورد ارزيابي كيفي قرار گرفتند. يك جايگاه چند ‌شكلي تك نوكلئوتيدي (SNP) معني‌دار با صفات توليدي از ژنCDKN1A انتخاب شد و سپس از تكنيك Mass Array(iPLEX) براي تعيين ژنوتيپ جايگاه مورد مطالعه استفاده شد. داده هاي آللي و ژنوتيپي با نرم افزار POPGENE مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. در اين پژوهش سه ژنوتيپ CC، CT و TT با فراواني به ترتيب 0/63، 0/35 و 0/02 همچنين دو آلل C و T با فراواني هر يك به ترتيب 0/80 و 0/20 مشاهده شد. با توجه به چند شكل بودن جايگاه مورد مطالعه مي توان از آن به عنوان يك نشانگر ژنتيكي در مطالعات مرتبط به هم بستگي بين ژنوتيپ و ركوردهاي فنوتيپي بهره برد.

The CDKN1A gene (a cyklin-dependent kinase A1 inhibitor) has a lot of genetic effects on protein and other traits in cows. The purpose of this study was to identify allelic variants in single nucleotide mutations of the CDKN1A gene. Blood sampling was carried out from 384 head of Holstein dairy cows DNA was extracted using optimized salting out method. The obtained DNA samples were evaluated qualitatively by agarose gel electrophoresis method. A single-nucleotide polymorphism (SNP) of CDKN1A gene significantly associated with production traits was selected and then the mass-array (iPLEX) technique was used to genotype the mentioned marker site. The alleles and genotypes data was analyzed using POPGENE software. In this study, three genotypes of CC, CT and TT were identified with frequencies of 0.63, 0.35 and 0.02 respectively. Also, the frequency of C and T alleles were determined as 0.80 and 0.20, respectively. Due to the polymorph behavior of the studied marker site, it can be used as a genetic marker in studies related to the correlation between genotype and phenotypic records.