بررسي جهش هاي تك نوكلئوتيدي ژن ACAT2 مرتبط با صفات توليد مثلي با روش iPLEX

Detection of single nucleotide polymorphism of ACAT2 gene associated with reproductive traits by iPLEX method

صفات توليد مثلي يكي از مهترين صفات در صنعت دامپروري مي باشند كه قسمتي از آن توسط ژنتيك تعيين مي شود. در چند دهه اخير، مطالعه روي اين صفات نشان داده است كه باروري با توليد شير رابطه معكوس دارند، كه اين امر مي تواند به دليل همبستگي ژنتيكي منفي ميان باروري و توليد شير باشد. در پژوهش حاضر تنوع آللي در دو جايگاه در ژن ACAT2 به عنوان يك ژن كانديد موثر بر باروري با روش iPLEX مورد مطالعه قرار گرفت. در پژوهش حاضر تعداد 384 نمونه خون از گاو هلشتاين تهيه و DNA آن‌ها با روش نمكي بهينه يافته استخراج و تعيين ژنوتيپ نمونه ها با تكنيك iPLEX انجام شد. در اين پژوهش دو جايگاه SNP(rs379096458) و SNP(rs462082890) از ژن ACAT2 مورد بررسي قرار گرفتند. با تعيين ژنوتيپ صورت گرفته روي اين SNPها اين نتيجه حاصل شد كه هر دو SNPمونومورف بوده و در گاوهاي هلشتاين در مازندران هيچ تنوع آللي را نشان ندادند. مطالعه روي واريانت هاي ديگر اين ژن پيشنهاد مي شود.

Reproductive traits are one of the most important traits in the livestock industry, partly determined by genetics. Over the past few decades, studies on these traits have shown that infertility is inversely related to milk production, which is due to the negative genetic correlation between fertility and reproduction. In present study, allelic variants in two position of ACAT2 gene as a candidate gene affecting fertility were studied using iPLEX method. In present study, 384 blood samples were collected from Holstein cows and DNA was extracted by modified salting out method and genotyped by iPLEX technique. In this study, two SNPs (rs379096458) and SNP (rs462082890) from the ACAT2 gene were investigated. By genotyping for these SNPs, it was concluded that both SNPs were monomorphic and showed no allelic diversity. Study on other variants of this gene is recommended.