تعيين توالي و آناليز بيوانفورماتيكي ژن پروتئين شوك حرارتي (Hsp70) بز عدني ايران

Sequencing and Bioinformatics Analysis of the Heat Shock Protein (Hsp70) Gene in Iranian Adani Goat

پروتئين هاي شوك حرارتي خانواده‌اي از پروتئين ها هستند كه در پاسخ به شرايط استرس زا در سلول توليد مي شوند. بسياري از اعضاي اين خانواده به عنوان چاپرون عمل مي كنند و با قرار گرفتن اطراف پروتئين هاي ديگر از تغييرات در ساختار انها جلوگيري كرده و سبب پايداري ساختار آنها مي شوند. هدف از پژوهش كنوني تعيين توالي ژن شوك حرارتي 70 بز عدني و پيش بيني توالي اسيد امينه پروتئيني آن به روش بيوانفورماتيك بود. براي انجام اين آزمايش 7 نمونه خون از مناطق مختلف استان بوشهر تهيه گرديد. پس از استخراج DNA با استفاده از دو پرايمر ژن شوك حرارتي 70 به روش واكنش زنجيره اي پليمراز تكثير و تعيين توالي شد. توالي نوكلئوتيدي و امينواسيدي پروتئين شوك حرارتي 70 بز عدني بيشترين شباهت را به پروتئين شوك حرارتي بز لژي بلك كشور چين (99/90 درصد) و بز تبت (99/9 درصد) دارد و شباهت كمتري به توالي رفرنس بز در NCBI دارد (99/43 درصد). مشابهت زياد توالي پروتئين شوك حرارتي 70 در سه نژاد بز عدني، لژي بلك (چين) و تبت مي تواند نشاندهنده رابطه نزديك فيلوژنيك آنها و وجود جد مشترك باشد.

Heat shock proteins (HSP) are a family of proteins that are produced by cells in response to exposure to stressful conditions. Many members of this family perform chaperone function by stabilizing new proteins to ensure correct folding or by helping to refold proteins that were damaged by the cell stress. The purpose of the present study was to determine sequences of HSP70 gene, and to analysis of heat shock protein 70 (HSP 70), using bioinformatics methods in Adani goat. To do this research, 7 blood samples were taken from different location of Bushehr province. After DNA extraction, using two primers, HSP70 gene were amplified using PCR method and sequenced. The nucleotide and amino acid sequences of 70 heat stress proteins (HSP70) have the most similarity to the heat shock protein of Lezhi black (99.99%), followed by Tibetan goat (99.9%), and is less similar to the goat reference sequence (NCBI) 43.99 percent). The high similarity of the HSP70 sequence in the three goat breeds (Adani, Lezhi black and Tibet) can be indicative of their close phylogenetic relationship and common ancestor.