مقايسه كميت و كيفيت DNA استخراج شده از نخود با استفاده از روش هاي مختلف دستي براي مطالعات اپي ژنتيك

Comparison of the quality and quantity of extracted DNA from chickpea using different manual methods for epigenetic studies

دستيابي به محتوي ژنتيكي نمونه هاي زيستي از اولين نيازهاي مطالعات ژنتيك مولكولي به شمار ميرود. روش استخراج محتوي ژنتيكي با توجه به نوع بافت، سلول، محتويات سلولي با يكديگر متفاوت هستند. در تحقيق حاضر، سه روش استخراج DNA از گياه نخود مورد بررسي و آزمون قرار گرفته است. هدف اين پژوهش شناسايي روشي با كيفيت مناسب به منظور تحقيقات اپيژنتيكي است. در اين مطالعه از بافت گياهي تازه نخود نمونه برداري انجام شد؛ سپس به سه روش سريع CTAB، دويل و همكاران، موري و تامسون DNA استخراج شده، و هركدام از روشها در غالب طرح كاملا تصادفي با سه تكرار ارزيابي شدند. غلظت نمونه هاي استخراج شده با استفاده از دستگاه اسپكتروفتومتري و ژل الكتروفورز اندازه گيري شد. يافته هاي اين پژوهش نشان دادكه: در بين روشهاي مورد ارزيابي روش سريع CTAB داراي واضحترين باند بود؛ DNA استخراج شده در روش سوم بهترين كيفيت را داشت و بيشترين نسبت جذب طول موج 280/260 را نشان داد. از نظر كميت DNA ي استخراج شده، روش دوم بيشترين و روش سوم كمترين غلظت را نشان داد. در مجموع از يافته هاي اين پژوهش ميتوان نتيجه گرفت كه روش اول واضح ترين باندها، روش دوم بيشترين غلظت DNA، روش سوم بيشترين خلوص را نشان ميدهد. در بين روش هاي مورد بررسي روش دوم به عنوان بهترين روش براي تحقيقات اپي ژنتيكي مي باشد.

Access to the genetic component of biological samples is one of the Necessary for molecular genetic studies. The quantity and quality of genetic extracted is one of the issues that are considered in selecting the extraction method for epigenetic purposes. In this study, three methods of DNA extraction from chickpea were investigated. The purpose of this study was to identify a suitable quality method for epigenetic research. sampling were did from fresh plant tissue. Then DNA was extracted in three method: rapid CTAB, Doyle et al., Murry and Thompson. Each method was evaluated in a completely randomized design with three replications. Concentrations of samples were measured by spectrophotometer and electrophoresis gel. The findings of this study showed that: Among evaluated the rapid CTAB method had the most obvious bands; The extracted DNA in the third method was significantly different from the other methods in terms of quality and showed the highest absorption ratio of 260/220. In terms of the quantity, the second method showed the highest and the third method the lowest concentration, while the second and third methods did not differ significantly, but the third method showed a significant difference. In conclusion, it can be concluded that the first method shows the most obvious bands, the second one shows the highest DNA concentration, the third one shows the highest purity. The second method is the best method for epigenetic research.