رواﺑﻂ ﻓﯿﻠﻮژﻧﺘﯿﮑﯽ ﺑﺮﺧﯽ ﮔﯿﺎﻫﺎن داروﯾﯽ ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از ﺑﺎرﮐﺪ ﮔﺬاري DNA

Phylogenetic analysis of some medicinal plant using DNA-barcoding

باركد گذاري DNA روشي ساده براي شناسايي گونه ها با استفاده از يك توالي كوتاه ژنتيكي از يك ناحيه خاص ژنوم است.تنوع آللي 7 گياه داروييمختلف از استانهاي ايلام و خوزستان با استفاده از اين تكنيك مورد استفاده قرار گرفت. استخراج DNA به روش تغيير يافته CTAB انجام گرفت و PCR با آغازگرهاياختصاصي براي ژن ITS1 انجام شد. سپس،محصولاتPCR خالص سازي وتعيين توالي شدند. نتايج ما نشان مي دهد كه اختلاف بسيار زيادي بين قطعات تكثير شده ژن ITS1 در نمونه هاي مختلف روي ژل آگارز مشاهده شد. همچنين، اختلاف زيادي بين توالي هاي تكثير شده براي هر نمونه به دست آمد. علاوه بر اينها، جستجوي نوكلئوتيدي توالي ها نشان داد كه شباهت بسيار بالايي (بيش از 90 درصد) بين توالي هاي به دست آمده و توالي هاي پايگاه NCBI وجود دارد. تجزيه خوشه اي با روش UPGMAبراي ژن ITS1 نشان داد كه امكان گروه بندي دقيق نمونه ها بر اساس اين روش وجود دارد.

DNA barcoding is simple method for identifying species using genetic short sequence from specific region of genome. Allelic diversity of 7 different medicinal plants from Ilam and Khuzestan province were evaluated using this technique. DNA was extracted by CTAB modify methodand PCR has been done using specific primers for ITS1 genes. Then, PCR product purified and sequenced. Our results indicated that there is high variation among PCR amplify of ITS1 gene in different samples on agarose gene. Also, a large difference between the amplified sequences for each gene was observed. Indeed, nucleotide blast of obtained sequences show that there is high homology (>90) between our sequence and NCBI data. Clustering analysis using UPGMA method for ITS1 gene show that the possibility of grouping and detailed breakdown based on this method.