آناليز بيان افتراقي ژنهاي بافت جنين زنبورعسل در ساعات پس از تخم گذاري با استفاده از داده‌هاي ترانسكريپتوميكس

در پژوهش حاضر با هدف مطالعه پروفايل بيان ژن و تعيين ژن‌هاي شاخص با بيان متفاوت و معني‎دار به طور مجزا در هر گروه نر و ماده بين سه زيرگروه، شامل ساعات پس از تخم‌گذاري (10الي15ساعت (زيرگروه1)، 20الي45ساعت (زيرگروه2) و 55الي70ساعت پس از تخم گذاري (زيرگروه3)) پس از اخذ و ذخيره داده‌هاي خام، مراحل آناليز به ترتيب با استفاده از نرم‌افزارهاي Fastq-dump، FastQC و Trimmomatic، Hisat2، Samtools و Cufflinks انجام شده و در نهايت آناليز هستي‌شناسي به وسيله پايگاه‌هاي اطلاعاتي DAVID و Ensemble صورت گرفت. طبق نتايج پروفايل بيان ژن، 17786 شناسه ژن مشخص شد، كه در نهايت با در نظر گرفتن log2(fold_change) 10 و log2(fold_change) -10 در گروه ماده‌ها بين زيرگروه‌هاي1و2، شش ژن، زيرگروه‌هاي 1و3، 23 ژن و زيرگروه‌هاي 2و3، 12 ژن شاخص و همچنين در گروه نرها بين زيرگروه‌هاي 1و2، دو ژن، زيرگروه‌هاي 1و3، 25 ژن و زيرگروه‌هاي 2و3، شش ژن شاخص با بيان متفاوت و معني‌دار شناسايي شد (q_value 0.001). نتايج آناليز هستي‌شناسي ژن‌هاي شاخص نشان داد كه در گروه نر و ماده‌، ژن‌هاي شاخص در اجزاي ساختاري كوتيكول، فعاليت اندوپپتيداز نوع سرين، اتصال يون روي و كلسيم و بيوسنتز هورمون حشرات نقش دارند.