مطالعه ارتباط ژنومي موثر بر ميزان توليد شير در گاو شيري

مطالعات پویش كلی ژنومی رویكردی مفید در شناخت ژن های تاثیرگذار بر ویژگی های اقتصادی مهم در گاو شیری میباشد. در اینجا، نتایج حاصل از مطالعات پویش كلی ژنومی براساسی تراكم بالای داده های ژنتیكی چندریختی تكنوكلئوتید، به طور مخفف اسنیپ، و ارزش تخمینی پرورش به ازای نه تولید ، باروری، ساختار بدن، صفت های كارایی و سلامت پستان در نژاد گاو براون سوئیس مطالعه شده كه بخشی از موسسه بین المللی ارزیابی ژنومی میباشد. مطالعات ارتباط كلی ژنومی و ارزش تخمینی پرورش افزایش یافته به ازای نه صفت صورت گرفت. نه صفت تولیدی عبارت بودند از : تولید شیر، تولید چربی، تولید پروتئین، توانایی شیردهی گاو پس از زایمان، لاغری ، پهنای بدن، قامت، نشان سلولی بدنی شیر و سرعت شیر دوشی، تجزیه و تحلیلی ها با استفاده از یك مدل خطی تركیبی اصلاح شده برای ادغام نژاد انجام شد. مجموع ۷۴ اسنیپ به جهت اهمیت داشتن كل ژنومی در ارتباط با یك یا چند صفت از نه صفت تولیدی بررسی شده، كشف شد. قوی ترین نشانه بر روی كروموزوم ۲۵ در صفات تولید شیر، قامت و پهنای بدن گاو شناسایی شد. نشانه های دیگر بر روی كروموزوم ۱۱ در لاغری، كروموزوم ۲۴ در نشان سلولی بدنی و كروموزوم ۶ در سرعت شیر دوشی بودند. برخی از نشانه ها كاملا با اQT گزارش شده برای صفت های مشابه با نژاد گاوهای دیگر هم پوشانی دارد و نزدیك به میزان شایستگی ژن های كاندید برای بررسی های بیشتر قرار گرفت.

The genome-wide association study (GWAS) is a good approach to identify genes affecting important traits in dairy cattle. Here, some report the results from a GWAS based on highdensity SNP genotype data and estimated breeding values for nine production, fertility, body conformation, udder health and workability traits in the Brown Swiss cattle population that is part of the international genomic evaluation program. GWASs were performed data and deregressed estimated breeding values (DEBVs) for nine traits from between 2061 and 5043 bulls that were part of the international genomic evaluation program coordinated by Interbull Center. The nine traits were milk yield (MY), fat yield (FY), protein yield (PY), lactating cow’s ability to recycle after calving (CRC), angularity (ANG), body depth (BDE), stature (STA), milk somatic cell score (SCS) and milk speed (MSP). Analyses were performed using a linear mixed model correcting for population confounding. A total of 74 SNPs were detected to be genome-wide significantly associated with one or several of the nine analyzed traits. The strongest signal was identified on chromosome 25 for milk production traits, stature and body depth. Other signals were on chromosome 11 for angularity, chromosome 24 for somatic cell score, and chromosome 6 for milking speed. Some signals overlapped with earlier reported QTL for similar traits in other cattle populations and were located close to interesting candidate genes worthy of further investigations.