تعيين توالي ژن VP28 يك جدايه ويروس لكه سفيد از ميگوي سفيد غربي (Litopenaeus vannamei) در استان خوزستان - ايران

Sequence analysis of VP28 gene of white spot virus isolated from White Leg shrimp( Litopenaeus vannamei) in Khuzestan province-Iran

بيماري لكه سفيد يكي از خطرناك ترين بيماري هاي ويروسي است كه سبب تلفات زيادي در ميگوهاي پرورشي در سطح جهان مي شود. اين بيماري در ايران نيز خسارت جدي به پرورش دهندگان ميگو وارد نموده است. در اين تحقيق طي بازديد از مزارع پرورش ميگوي استان خوزستان در منطقه چوئبده آبادان از ميگوهاي مبتلا به بيماري لكه سفيد كه داراي علائم باليني بودند نمونه برداري انجام شد. نمونه اي كه داراي بالاترين حدت از بيماري لكه سفيد بود به عنوان الگو در آزمايشات بعدي مورد استفاده قرار گرفت و اين جدايه IRI-KHZ/904 نام گذاري شد. به وسيله پرايمرهاي طراحي شده، ژن VP28 از ژنوم ويروس تكثير گرديد و توالي آن در بانك ژن با شماره دسترسي AB855742 ثبت گرديد. نتايج نشان داد كه توالي نوكلئوتيدي ژن VP28 در جدايه ايراني، با توالي جدايه هاي بسياري از كشورهاي مختلف جهان داراي همساني 100 درصد بود و با 4 جدايه از كشورهاي چين، كره جنوبي و هند 99 درصد همساني داشت.

White spot disease is one of the most serious viral diseases which affect farmed shrimp in the world. In Iran the disease maked serious damages to shrimp farmers. During a culture period، shrimp farms of Abadan were visited and those shrimps with clinical symptoms of WSSD were sampled. The samples which had the highest frequency of white spot disease were used as a template in subsequent experiments. This isolate was named: IRI-KHZ/904. By designing of primers، VP28 gene amplification and sequence was recorded in gene bank with accession number: AB855742. The nucleotide sequences obtained in this study had 100% homology with most isolates from different countries which recorded in the gene bank. Also in comparison with 4 other isolates that had been recorded in gene bank، Iranian isolate showed 99% homology