تنوع ژنتيكي و تبارشناسي كوكر شكم سفيد ( 1766،Pterocles alchata (Linnaeus با استفاده از توالي ناحيه سيتوكروم بي ميتوكندري در شمال شرق ايران (مطالعه موردي: منطقه گميشان)

Genetic Diversity and Phylogeny of Pin-tailed Sandgrouse Pterocles alchata (Linnaeus, 1766) by Sequencing of the Mitochondrial Cytochrome b in Northeast Iran (Case Study: Gomishan

يكي از بزرگ ترين جمعيت هاي كوكر شكم سفيد (Pterocles alchata) با بيش از چند هزار قطعه در فصل پاييز و زمستان در منطقه گميشان استان گلستان پراكنش دارد. اين گونه در زيستگاه هاي استپي خشك، باز و بدون درخت و بوته هاي بلند زيست مي كند و با وجود كاهش جمعيت اين گونه به دليل استفاده از سموم آفت كش، شكار غيرقانوني، تغيير زيستگاه و اقليم، تاكنون هيچ گونه مطالعه بوم شناسي و ژنتيكي بر روي اين گونه در ايران صورت نگرفته است. در اين تحقيق براي دستيابي به اولين اطلاعات در مورد روابط ژنتيكي در ميان جمعيت هاي كوكر شكم سفيد در شمال شرق ايران 9 نمونه بافت اين گونه در منطقه گميشان جمع آوري شد. پس از استخراج دي ان اي، ژن سيتوكروم بي ميتوكندري در 9 نمونه توسط واكنش زنجيره اي پلي مراز، تكثير و 912 جفت نوكلئوتيد از اين ژن براي هر نمونه توالي يابي و ويرايش شد. براساس نتايج در بين نمونه هاي توالي يابي شده، سه هاپلوتايپ متفاوت شناسايي و تنوع هاپلوتايپي برابر با 0/417 برآورد شد. نتايج درخت تبارشناسي با روش Bayesian و بيش ترين احتمال نشان داد كه تمامي نمونه ها مربوط به يك شاخه هستند و به خوبي از دو گونه كوكرگندمي (P. coronatus) و كوكرناماكوا (P. namaqua) كه تنها توالي هاي ثبت شده از جنس كوكر در ژن بانك بودند جدا شده است كه اين امر بيانگر روند تكاملي خاص اين گونه از ساير گونه هاي اين جنس است. اين مطالعه به عنوان نقطه آغاز مطالعات بر روي كوكر شكم سفيد با استفاده از ناحيه سيتوكروم بي در دنياست كه مي تواند روابط تبارشناسي جمعيت هاي مختلف اين گونه را مشخص كند.

The Gomishan area of Golestan province holds one of the biggest populations of pin-tailed sandgrouse (Pterocles alchata)، which is estimated to reach more than a thousand individuals in the fall and winter. The species inhabits steppe habitats requiring dry، open grassland plains without trees or high bushes. Although this species is declining due to using pesticides، poaching، habitat destruction، and climate change، no studies have yet been conducted on the P. alchata in Iran، and also there is not any genetic and ecological data in relation to this species. In order to achieve basic information about genetic relations among Pin-tailed sandgrouse populations in Northeast Iran، nine tissue samples of Gomishan area were collected. After DNA extraction، nine samples were amplified with polymerase chain reaction، and 912 base pair of mitochondrial cytochrome b was sequenced. As a result of this investigation، it was discovered that the Gomishan population contains three different haplotypes and haplotype diversity was 0.417. The results of Bayesian and Maximum likelihood trees illustrate that all specimens belong to a single clade، but separate completely from P. coronatus and P. namaqua which are only sequences of Pteroclididae in GenBank. This study is starting point of investigations on the P. alchata in the world and it could be resolved the relationships among different populations of Pin-tailed sandgrouse.