شناسائي مولكولي و آناليز فيلوژني زوانتارين ها براساس نشانگر ITS - rDNA در جزيره لارك، خليج فارس

Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of zoantharians based on ITS- rDNA marker in Larak Island, the Persian Gulf

راسته Zoantharia (Zoantharian) يكي از راسته هاي بسترزي شاخه گزنه سانان (Cnidarian) مي باشد كه پراكنش وسيعي در مناطق آبسنگي خليج فارس دارند. مطالعه حاضر اولين بررسي تنوع زيستي اين راسته با استفاده از نشانگر هسته اي (ITS- rDNA) در خليج فارس مي باشد. بدين منظور پانزده كلني جمع آوري شده از جزيره لارك از آزمايشگاه بيولوژي دريا واحد علوم و تحقيقات تهران تهيه شد. DNA نمونه ها با استفاده از كيت Bio Basic INC استخراج شد. سپس واكنش زنجيره اي پلي مراز با استفاده از آغازگر هاي اختصاصي زوانتارين جهت تكثير قطعه ژني ITS- rDNA انجام شده و محصولات به دست آمده توالي يابي شدند. داده ها با استفاده از نرم افزارهاي MEGA5 و MrBayes آناليز شدند. نتايج بررسي فيلوژني توالي هاي به دست آمده از نشانگر هسته اي حاكي از وجود سه گونه Zoanthus sansibaricus، Palythoa aff. mutukiوPalythoa tuberculosa در اين منطقه مي باشد كه بررسي پيشين با استفاده از نشانگر ميتوكندريايي را تاييد كرد. از آن جايي كه ITS كپي هاي متعدد اينتراژنوميك دارد و در نتيجه داراي تنوع بالايي مي باشد، برخلاف نشانگرهاي ميتوكندريايي نمي توان به عنوان DNA barcode استفاده شود ولي استفاده از آن به يقين مي تواند در تاييد صحت اطلاعات به دست آمده از نشانگرهاي ميتوكندريايي بسيار كارآمد باشد. توالي هاي به دست آمده از نمونه هاي خليج فارس تفاوت قابل ملاحظه اي با توالي هاي نمونه هاي مشابه در ساير مناطق جهان داشتند. در اين راستا بايستي تاثير شرايط اكولوژيك خليج فارس بر جهش ژني در زوانتارين ها بررسي گردد.

The order Zoantharia (zoantharian) is a group of benthic Cnidarians which is widely distributed in coral reef ecosystems of the Persian Gulf. In the present study for the first time the nuclear marker (ITS-rDNA) was used to examine the diversity of zoantharians in the Persian Gulf. Fifteen colonies، collected off Larak Island، were received from Marine Biology laboratory of Science and Research Branch-IAU. Bio Basic INC kit was used for DNA extraction and ITS-rDNA gene was amplified using zoantharian specific primers. Subsequently، all PCR products were sequenced. The data analysis was conducted using MEGA5 and MrBayes. Molecular phylogeny، using nuclear DNA marker، confirmed the presence of three zoantharian species in this region including Zoanthus sansibaricus، Palythoa aff. mutuki and Palythoa tuberculosa. The results of this study were consistent with the previous phylogenetic studies based on mitochondrial DNA markers. ITS-rDNA is not a highly conserved region and has multiple intragenomic variants therefore could not be used as a DNA barcode. However، using this nuclear marker can confirm the results of conservative mitochondrial marker. The obtained sequences during the present study showed considerable differences with previously reported sequences from all over the world. It might be concluded that the ecological conditions of the Persian Gulf may have caused gene mutation which should be further investigated.