بررسي ارتباط پلي مورفيسم ژن CPEB1 با ناباروري در مردان ايراني

Association between CPEB1 gene polymorphism and Iranian male infertility

مقدمه: اسپرماتوژنز يك فرآيند بسيار كنترل شده براي توليد اسپرم بالغ است. براي توليد اسپرم بالغ از گامت، نياز به تنظيمات رونويسي و پس از رونويسي است. پروتئين CPEB1 پلي آدنيليشن سيتوپلاسمي mRNA را در اژنز و اسپرماتوژنز كنترل مي كند. هدف از اين تحقيق بررسي ارتباط پلي مورفيسم تك نوكلئوتيدي 2303846 rs كه در موقعيت 3’ UTR ژن CPEB قرار گرفته است با ناباروري در مردان ايراني مي باشد. روش بررسي: دراين تحقيق مورد- شاهدي تعداد 140 نمونه خون از جمعيت هاي مختلف ايراني (70 سالم و 70 نابارور) تهيه شد. ژنوتيپ هاي rs2303846 توسط روش PCR-RFLP تعيين و با روش توالي يابي تاييد گرديد. سرانجام اطلاعات حاصله از طريق نرم افزار آنلاين SNPSTAT و SPSS مورد تجزيه تحليل آماري قرار گرفت. ارتباط اين پلي مورفيسم با miRNA ها نيز بررسي شد. نتايج: نتايج بدين صورت بود كه ژنوتيپ TT تنها در 5 نفر از 70 نمونه افراد نابارور مشاهده گرديد، درصورتي كه همه افراد كنترل داراي ژنوتيپ CC بودند، اختلاف معناداري ديده مي شود (P=0.023). پلي مورفيسم 2303846 rs در ناحيه seed سه (hsa-miR-143-5p, hsa-miR- 6511b-5p, hsa-miR-3944-5p) قرار دارد و آلل T سبب از بين رفتن seed مي شود. همچنين آلل T منجر به سست شدن اتصال همه miRNA هاي انتخابي مي شود. نتيجه گيري: پلي مورفيسم (rs C/T 2303846) واقع در ژن CPEB1 مي تواند با خطر ابتلا به ناباروري در مردان ايراني مرتبط باشد. همچنين بررسي هاي بيوانفورماتيكي نشان داد كه با تغيير آلل T به جاي C در 2303846 rs، اتصال mRNA ژن CPEB1 به miRNA هاي تنظيم كننده آن كاهش مي يابد، در نتيجه ژن پايدار و بيان آن ادامه مي يابد.

Introduction: Spermatogenesis is a strictly regulated process in sperm production that is needed for sperm production transcriptional and posttranscriptional regulations. The cytoplasmic polyadenylation element binding (CPEB) protein regulates cytoplasmic polyadenylation of mRNAs in oogenesis and spermatogenesis. The purpose of the present studywas examining the association between rs2303846، which is located at 3'UTR of CPEB gene، and Iranian male infertility. Methods: In this case–control analysis، 140 blood samples were collected (70 fertile men and 70 infertile men). rs2303846 genotypes were determined by PCR-RFLP method and the results were confirmed by sequencing. The differences in genotype distributions between cases and fertile controls were examined using Chi-squared analysis and SNPSTAT software. Corelation between this SNP and miRNAs was examined. Results: TT genotype was observed in 5 infertile men among 70 case samples، while all control samples showed CC genotype and there was a significant association in this difference (P= 0.023). This SNP exist in seed region of three miRNAs (hsa-miR-143-5p، hsa-miR- 6511b-5p، hsa-miR-3944-5p) and T allele causes seed destruction. In addition، T allele leads to the loose binding of all the selected miRNAs. Conclusion: Our results indicate that rs2303846، which is located on CPEB1 is associated with the risk of infertility in Iranian population. Our bioinformatics analysis showed that changing the T allele of rs2303846، instead of C allele could loose miRNA binding to their target genes in our selected miRNAs. Consequently، the gene is stable and its expression continues.