بررسي گروه‌هاي فيلوژنيك باكتري اشريشيا كلي جدا شده ازمدفوع طيور بر اساس ژن‌هاي chu, yio, tspe جدا شده از استان كرمان

Stuying phylogenetic groups of Escherichia isolated from poultry feces based on genes chu, yio, tspe isolated from Kerman province

اشريشيا كلي يك باكتري گرم منفي روده‌اي و عامل بيماري‌هاي مهمي در طيور و همچنين در انسان و داراي اهميت زئونوتيك مي‌باشد. اين باكتري از لحاظ فيلوژني به چهار گروه A، B1، B2 و D و زيرگروه‌هاي بيشتر تقسيم‌بندي مي‌شود كه اين تقسيم‌بندي داراي اهميت اپيدميولوژيك مي‌باشد. هدف از مطالعه حاضر بررسي شيوع گروه‌هاي فيلوژنيك اشريشيا كلي در سويه‌هاي جداسازي شده از مدفوع طيورگوشتي بود. در اين مطالعه 60 نمونه اشريشيا كلي جداسازي شده از طيور جمع‌آوري و با آزمون‌هاي كشت و بيوشيميايي تاييد شدند. آزمون triplex-PCR بر روي جدايه‌ها و با استفاده از ژن‌هاي chuA، yjaA و قطعه TspE4.C2 جهت تعيين گروه‌هاي فيلوژني انجام شد. نتايج مطالعه نشان داد گروه فيلوژني B2 داراي بيشترين فراواني در بين سويه‌ها بود و فراواني زيرگروه‌هاي A0، A1، B1، B22، B23، D1 و D2 به ترتيب 3/18 درصد، 3/8 درصد، 6/1 درصد، 5 درصد، 6/41 درصد، 3/3 درصد و 6/16 درصد بود. نتايج مطالعه حاضر نشان داد بيشترين سويه‌هاي اشريشيا كلي جداسازي شده از مدفوع طيور گوشتي متعلق به گروه فيلوژني B2 بودند كه اين گروه در انسان نيز از پاتوژن‌هاي مهم خارج روده‌اي مي‌باشد و نشان دهنده اهميت زئونوتيك جدايه‌هاي مورد بررسي مي‌باشد.

Escherichia coli is a gram negative enteric bacteria and the causative agent of important diseases in poultry and humans and has zoonotic importance. This bacteria is divided into four phylogenetic groups including A1, B1, B2 and D and more subgroups which has epidemiologic importance. The aim of study is to evaluate the prevalence of phylogenetic groups of E. coli strains isolated from poultry feces. In this study 60 samples of E. coli isolated from poultry were collected and confirmed by culture and biochemical tests. Triplex-PCR was done on the isolates and by chuA, yjaA genes and TspE4.C2 to determine the phylogenetic groups. The results of the study showed the phylogroup B2 was the most group identified and the subgroups A0, A1, B1, B22, B23, D1 and D2 were observed in 18.3%, 8.3%, 1.6%, 5%, 41.6%, 3.3% and 16.6% of the isolates. This study showed the most strains of E. coli isolated from feces of poultry belonged to B2 phylogenetic group which is an exteraintestinal pathogen group in humans and shows the zoonotic importance of these isolates.