افزايش خطر ابتلا به سرطان معده با چند شكلي VNTR ژن SIRT3

Increased Risk of Gastric Cancer with VNTR Polymorphism of SIRT3 Gene

سابقه و هدف: در سراسر جهان، سرطان معده يكي از شايع ترين سرطان ها است كه با مرگ و مير بالا همراه است. يكي از ژن هايي كه در سرطان معده كاهش بيان دارد، ژن SIRT3 مي باشد كه كد كننده آنزيم هيستون داستيلاز است. در اينترون 5 ژن SIRT3 يك چند شكلي VNTR (Variable Number Tandem Repeat) است و مطالعات نشان داده است كه با افزايش تعداد تكرارها بيان ژن SIRT3 افزايش مي يابد. با توجه به تغيير بيان ژن SIRT3 در سرطان معده و نقش VNTR اينترون 5 اين ژن در ميزان رونويسي، اين مطالعه با هدف بررسي ارتباط چند شكلي VNTR اينترون 5 ژن SIRT3 با خطر ابتلا به سرطان معده انجام شده است. مواد و روش ها: در اين مطالعه مورد- شاهدي 116 بيمار مبتلا به سرطان معده مراجعه كننده به بيمارستان اميد اصفهان و 116 فرد سالم طي سال هاي 1392 تا 1394 شركت داشتند كه پس از استخراج DNA با تكنيك PCR و الكتروفورز ژنوتيپ تمامي افراد تعيين گرديد و نتايج حاصل با آزمون هاي آماري رگرسيون لجستيك و X2 آناليز شد. يافته ها: در اين مطالعه علاوه بر آلل هايي كه تاكنون گزارش شده بود، آلل هاي با 8 و 9 تكرار نيز مشاهده گرديد. نتايج اين مطالعه نشان داد كه ژنوتيپ 4-1، با خطر ابتلا به سرطان معده ارتباط معني داري نشان مي دهد (P=0.028, OR= 13.00). استنتاج: بعضي از واريانت هاي چند شكلي VNTR اينترون 5 ژن SIRT3 با خطر سرطان معده ارتباط آماري معني داري نشان مي دهد.

Background and purpose: Gastric cancer is the most common cancer associated with high mortality worldwide. One of the genes that is down-regulated in gastric cancer, is the SIRT3 that encodes the histone deacetylase enzyme. There is a variable number tandem repeat (VNTR) polymorphism in the intron 5 of SIRT3 gene and evidence shows that expression of SIRT3 gene increases by increase in the number of repeats. According to the deregulation of SIRT3 gene expression in gastric cancer and the effect of intron 5 VNTR polymorphism in the transcription, we investigated the association between intron 5 VNTR polymorphism of SIRT3 gene and the risk of developing gastric cancer. Materials and methods: A case-control study was performed in 116 patients with gastric cancer (attending Isfahan Omid Hospital, Iran) and healthy controls (n= 116). After DNA extraction, all samples were genotyped using PCR and electrophoresis techniques and the results were analyzed applying logistic regression and Chi-square tests. Results: In addition to the alleles that have been reported so far, alleles with 8 and 9 repeats were observed too, in this study. The results showed that genotype 4-1 increases significantly the risk of gastric cancer (P=0.028, OR= 13.00). Conclusion: Some variants of intron 5 VNTR polymorphism SIRT3 gene is associated with risk of developing gastric cancer