جداسازي و شناسايي استرپتوكوكوس پنومونيه از بيماران بستري در بيمارستان‌ هاي تهران در سال‌ هاي 1394-1392

Isolation and Identification of Streptococcus pneumoniae from Admitted Patients in Tehran Hospitals in during 2013-2015

زمينه و اهداف: استرپتوكوكوس پنومونيه (پنوموكوك) باكتري بيماري هاي گرم- مثبت است كه عامل ايجاد پنوموني، سپتي سمي، مننژيت، عفونت گوش مياني، سينوزيت، برونشيت، باكتريمي و ساير پروسه هاي عفوني معرفي شده است. با توجه به اهميت باليني اين باكتري و جداسازي و تشخيص درست و به موقع آن از نمونه هاي بيماران، اين مطالعه به منظور شناسايي و جداسازي سويه هاي پنوموكوك از نمونه هاي باليني به روش هاي كشت و PCR انجام شده است. مواد و روش كار: در اين مطالعه تعداد 175 نمونه باليني مختلف از بيماران بستري در بيمارستان هاي شهر تهران طي مدت 3 سال (1394-1392)، جمع آوري و از روش هاي كشت و PCR (پس از استخراج ژنوم و در حضور پرايمر اختصاصي)، براي جداسازي و شناسايي سويه هاي پنوموكوك در كنار سويه استاندارد 49619 ATCC (به عنوان كنترل) استفاده گرديد. يافته ها: در اين تحقيق، تعداد 40 سويه پنوموكوك به روش هاي كشت و PCR شناسايي و مورد تاييد قرار گرفته است. آمپليكون تكثيرشده در اين تحقيق يك قطعه 160 جفت بازي بود كه در همه سويه هاي استرپتوكوكوس پنومونيه يافت گرديد. نتيجه تعيين توالي نيز محصول PCR را تاييد نمود. نتيجه گيري: طبق نتايج به دست آمده در اين مطالعه،PCR همانند كشت، روشي مطمئن اما نسبتاً سريع تر از آن ارزيابي شده است كه در آينده مي تواند جايگزين روش هاي قديمي و متداول (آزمايش هاي بيوشيميايي و كشت) گردد.

Background and Aim: Streptococcus pneumoniae is Gram-positive bacterium that causes pneumonia, septicemia, meningitis, otitis media, sinusitis, bronchitis, bacteremia and infectious processes is introduced. Due to the clinical importance of this bacterium and correct and timely diagnosis and separation of isolated samples from patients, this study were performed to identify and isolate strains of Pneumococcus from clinical samples by culture and PCR methods. Materials and Methods: In this study, 175 various clinical samples were collected from admitted patients in Tehran hospitals during 3 years (2013-2015),and culture and PCR methods used to isolate and identify of strains of Pneumococcus (after genome extraction and in the presence of specific primer) beside the standard strain ATCC 49619 (as control). Results: In this study, 40 strains of Pneumococcus have been identified and approved by culture and PCR methods. Amplified amplicon in this study, was a 160 bp fragment that were found in all strains of Streptococcus pneumoniae. Also, the PCR product was confirmed by sequencing. Conclusions: According to the obtained results in this study, PCR similar to culture, is a reliable method, but has been assessed relatively faster that can be used in the future to replace the old and conventional methods (biochemical tests and culture).