بررسي تنوع ژنتيكي بنفشه‌ آفريقايي با استفاده از ماركر مولكولي RAPD

Assesment of genetic diversity Saintpaulia inonatha using RAPD marker

به منظور بررسي تنوع ژنتيكي و ارزيابي ارقام مطرح بنفشه­ ي آفريقايي (Saintpauli ionantha در سطح مولكولي از نشانگر RAPD استفاده شد. در اين تحقيق 6 ژنوتيپ با 8 آغازگر مورد ارزيابي قرار گرفتند. از 8 آغازگر آزمايش شده روي DNA ژنومي 180 باند توليد شد كه 163 باند پلي مورف و 17 باند باقيمانده منومورف بودند. اندازه­ ي قطعات DNA توليد شده بين bp300 تا kb4 بود. آغازگر C 10 mer كمترين باند و آغازگر 10 mer E بيشترين تعداد باند را توليد كرد. باندهاي توليد شده براي آناليزهاي استاتيك مورد استفاده قرار گرفتند. محاسبات آماري بر اساس ضريب تشابه جاكارد و گروه ­بندي به روش دايس با استفاده از نرم­ افزار 2/02 Ntsys ver انجام شد. تشابه ژنتيكي بين 0/57 تا 0/72 بوده و ضريب جاكارد بين دندروگرام و ماتريس تشابه 0/85 به دست آمد كه نشان دهنده برازش مناسب دندروگرام به ماتريس تشابه بوده است. اين آزمايش نشان داد كه نشانگر RAPD براي بررسي تنوع ژنتيكي در ژنوتيپ‌هاي بنفشه ­آفريقايي يك تكنيك موثر و مفيد است.

Genetic diversity was studied of Saintpaulia inonatha using RAPD marker. The 8 primer used and produced 180 bands. The 163 bands were common in all the variety. Primer 10mer C, producted the least number of polymorphic bands while primers 10 mer A, producted the highest number of band. The sizes of the pieces have been produced between 300bp to 4kb. Ntsys ver 2/02 cluster analysis To draw a phylogenetic tree was used. The genetic similarity between 0.57 to 0.72 and jaccard coefficient between cluster and similarity matrix was 0/85. The results show among 6 variaty there is considerable genetic diversity. This study suggested that molecular markers RAPD useful tool for study genetic diversity among variatys of saintpaulia.