شناسايي ژنهاي ويرولانس در سويه هاي اشريشيا كلي جدا شده از كودكان مبتلا به عفونت دستگاه ادراري و تعيين مقاومت آنتي بيوتيكي آنها

DETECTION OF VIRULENCE GENES IN ESCHERICHIA COLI STRAINS ISOLATED FROM CHILDREN WITH URINARY TRACT INFECTION an‎d THEIR ANTIBIOTIC RESISTANCE PROFILE

پيشرمينه و هدف عفونت هاي دستگاه ادراري (UTI) يكي از شايعترين عفونتهاي سراسر جهان هستند. مبتلايان به عفونت ادراري اشرشياكلي (UPEC) پاتوژن اوليه اي كه باعث عفونت ادراري مي شوند. هدف از انجام اين مطالعه شناسايي ژنهاي مختلف papC، papG، fimH ، iutA ، sfaS ، ibeA و نيز بررسي ميزان حساسيت آنتي بيوتيكي ايزوله هاي اشريشياكلي جدا شده از نمونه ادراري مي باشد. مواد و روش كار در اين تحقيق توصيفي- مقطعي، 120 نمونه از كودكان مبتلا به عفونت دستگاه ادراري مراجعه كننده به مركز طبي كودكان در تهران جمع آوري و پس از جداسازي باكتري و استخراج DNA، آزمون هاي حساسيت آنتي بيوتيكي توسط روش ديسك ديفيوژن با آنتي بيوتيك هاي مورد نظر انجام گرفت. حضور ژن هاي كلاس papC، papG، fimH ، iutA ، sfaS و ibeA به روش PCR چندگانه اي مورد بررسي قرار گرفت. يافته ها نتايج نشان داد كه نمونه هاي اشريشياكلي جدا شده نسبت به آميكاسين (100 درصد) حساس و نسبت به آمپي سيلين (60 درصد) مقاومت داشته اند. فراواني ژنهاي تحت مطالعه papC (58%)، papG(47%)،fimH (85%)، iutA (35%)، sfaS (1%) و ibeA (1%) بود. بحث و نتيجه گيري نتايج اين مطالعه نشان داد كه ژن fimH و ژن papC شايع ترين ژن هاي شناسايي شده در اشريشياكلي جدا شده از عفونت دستگاه ادراري بوده است. علت تفاوت نتايج با ساير مطالعات به دليل تنوع منطقه جغرافيايي مي باشد.

Background & Aims: Urinary tract infections (UTI) are of the most common infections worldwide. Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) causing urinary tract infections are the primary pathogens. The aim of this study was to identify different genes papC, papG, fimH, iutA, sfaS, ibeA and antibiotic susceptibility of E. coli strains isolated from urinary tract infection. Materials & Methods: In this cross-sectional study, 120 samples were collected from patients with urinary tract infection who referred to Children Medical Center in Tehran, Iran. Antibiotic susceptibility testing by disk diffusion method was performed according to CLSI guidelines. Thus, DNA extraction was performed from all strains and multiplex PCR was conducted for detection of papC, papG, fimH, iutA, sfaS and ibeA virulence genes in all strains. Results: The results showed that E.coli isolates to amikacin (100%) sensitive and had resistance to ampicillin (60%). Virulence genes prevalence was fimH 85%, papC 58%, papG 47%, iutA 35%, sfaS 1% and ibeA 1%. Conclusion: The results of this study showed that the most common gene encoding genes fimH and papC adhesion genes in E.coli was isolated from urinary tract infection pap Fimbriae. The difference between the results with other studies is due to the diversity of geographic region