عنوان مقاله :
ارزيابي تنوع ژنتيكي اكوتيپ هاي خار مريم Silybum marianum L.)) با استفاده از نشانگرهاي ISSR
عنوان به زبان ديگر :
Assessment of Genetic Variation in Silybum marianum L. Using ISSR Markers
پديد آورندگان :
گنج خانلو، عليه دانشگاه تهران - گروه زراعت و اصلاح نباتات , طالعي، عليرضا دانشگاه تهران - گروه زراعت و اصلاح نباتات , مرادي، پرويز مركز تحقيقات زنجان , سبكدست، منيژه دانشگاه تهران - گروه زراعت و اصلاح نباتات
كليدواژه :
تجزيه به مولفه هاي اصلي , تجزيه خوشه اي , محتواي اطلاعات چندشكلي , نشانگر ISSR
چكيده فارسي :
به منظور بررسي تنوع ژنتيكي 77 نمونه خارمريم جمع آوري شده از 20 منطقه كشور ايران (7 استان)و يك رقم خارجي از بوداپست مجارستان، آزمايشي در قالب طرح بلوك هاي كامل تصادفي در مزرعه دانشكده كشاورزي دانشگاه زنجان با سه تكرار اجرا شد. در اين مطالعه تنوع ژنتيكي و گروه بندي اكوتيپ هاي مختلف خارمريم با استفاده از نشانگرهاي ISSR انجام شد. از 12 آغازگر مورد استفاده 10 آغازگر توانستند نوار چندشكل ايجاد كنند. بيشترين ميزان محتواي چندشكلي (PIC) مربوط به آغازگرهاي((0.492 UBC809 ، 0.487)) UBC 842 و UBC 826 (0.443) كمترين مقدار آن مربوط به آغازگر UBC1 (0.121) بود. تجزيه خوشه اي براساس الگوريتم UPGMA نمونه هاي مورد مطالعه را در 9 گروه قرار داد. به منظور تجزيه واريانس مولكولي يك تقسيم بندي اوليه بر اساس منطقه جغرافيايي اكوتيپ ها را در 8 گروه تقسيم بندي نمود. نتايج آن براي كل جمعيت (77 نمونه) و براي گروه هاي مورد مطالعه نشان داد كه واريانس درون جمعيت (84 درصد) نسبت به واريانس بين جمعيت (16 درصد) بيشتر بود طبيعت دگرگشن اين گياه و گرده افشاني باز دليل تنوع بيشتر درون گروهي نسبت به بين گروهي مي باشد. تجزيه به مولفه هاي اصلي، در مجموع شش مولفه با 5/87 درصد از تغييرات كل داده ها را توجيه نمود. توجيه در صد كمي از تغييرات كل توسط هر مولفه مي تواند بيانگر پوشش ژنومي مناسب نشانگرهاي ISSR انتخاب شده باشد. در مجموع نتايج حاصل از ISSR نشان داد كه اين تكنيك روش مناسبي براي مطالعه ساختار ژنتيكي جمعيت خارمريم است
چكيده لاتين :
To study the genetic diversity in 77 samples of Silybum marianum (consisting 21 ecotypes) were evaluated in a randomized complete block design with three replications in Agricultural site of University of Zanjan. Using ISSR markers, the genetic diversity of some ecotypes of Silybum marianum along with their classification were studied. Out of 12 ISSR primers, 10 were amplified. Results revealed that the highest polymorphism information content (PIC) value belongs to primers UBC809 (0.492), UBC842 (0.487), and UBC826 (0.443 (, and lowest value was that of primer UBC1 (0.121). Cluster analysis using UPGMA algorithm divided the lines into 9 separate groups. For molecular analysis of variance of ecotypes a primary classification based on the geographical area used which divided them into 8 groups. Results of molecular analysis of variance revealed that within population variance was higher than between group variance due to its open pollinating nature. Regarding to principal component analysis, the first six components explained 87.5 % of the total variance and each component accounts for a small percentage of the total variance that emphasizes on good genomic distribution of selected ISSR markers. In general, the results obtained for using ISSR markers showed that this technique is a suitable one to study the genetic structure of the population Silybum marianum
عنوان نشريه :
علوم گياهان زراعي ايران
عنوان نشريه :
علوم گياهان زراعي ايران