تايپينگ مولكولي جدايه‌هاي سالمونلا انتريكا سرووار اينفنتيس با استفاده از روش ERIC-PCR

Molecular Typing Isolates of Salmonella Enterica Serovar Infantis Using Eric-PCR Method

زمينه: سالمونلاها از باكتري‌هاي مهم خانواده انتروباكترياسه بوده كه از نظر بيوشيميايي و سرولوژيك بسيار متنوع مي‌باشند و عمدتاً از راه مواد غذايي منتقل مي‌شوند. گسترش سالمونلاهاي غير تيفوئيدي يكي از مهم‌ترين موضوعات قابل بررسي در تحقيقات امروزي مي‌باشد. بنابراين تشخيص و تايپينگ سريع اين بيماري‌زاها اطلاعات مناسبي در رديابي و كنترل عفونت در اختيار مي‌دهد. هدف از مطالعه حاضر تايپينگ سويه‌هاي باليني سالمونلا اينفنتيس مي‌باشد. مواد و روش‌ها: در اين پژوهش از مراكز درماني مختلف سويه‌هاي سالمونلا اينفنتيس جداسازي شد. تمامي سويه‌ها با استفاده از روش‌هاي استاندارد ميكروبيولوژي، بيوشيميايي و مولكولي مورد شناسايي قرار گرفتند. رابطه ژنتيكي سويه‌ها با استفاده از روش ERIC-PCR مورد بررسي قرار گرفت. يافته‌ها: در اين تحقيق از مجموع 842 نمونه مدفوع و خون بيماران مبتلا به اسهال، 48 سويه مربوط به سالمونلا اينفنتيس جداسازي شد. جدايه‌ها با استفاده از روش ERIC-PCR از نظر ژنوتايپينگ به 14 گروه مختلف دسته‌بندي شدند كه بيشترين تعداد سويه در گروه 5ام (20 درصد،10 سويه) جاي گرفتند. نتيجه‌گيري: نتايج اين مطالعه نشان داد كه سويه‌هاي سالمونلا اينفنتيس مورد مطالعه از نظر ژنتيكي متنوع بودند كه مي‌تواند به علت شيوع پلي كلونال سويه‌ها در نمونه‌هاي انساني باشد. همچنين نشان داده شد كه روش ERIC-PCR قدرت تمايزي بالايي را جهت تايپينگ مولكولي دارد.

Background: Salmonella are significant bacteria of the Enterobacteriaceae which are very diverse biochemically and serologically. These bacteria are primarily transmitted through food ingestion. The spread of non-typhoid Salmonella is one of the challenging issues in the current medical research. Therefore, rapid diagnosis and identifying the type of these pathogens provide crucial information for early detection and controlling the spread of the infection. The aim of this study was typing the clinical strains of Salmonella Infantis. Materials and Methods: In this study, strains of Salmonella Infantis were isolated from several health centers. All of the strains were identified by standard microbiology, biochemical and molecular methods. Genetic relationship between strains was analyzed using the ERIC-PCR method. Results: In this study, 842 stool and blood sample of patients with diarrhea were examined, and 48 different strains linked to Salmonella Infantis were isolated. Strains categorized into 14 different groups by genotyping using the ERIC-PCR method, and the highest number of the strains were placed in group 5 (20%, 10 strains). Conclusion: Results of this study revealed that strains of Salmonella Infantis which were examined genetically were rather diverse in nature. This could be due to the high prevalence of polyclonal strains in human samples. It was also shown that ERIC-PCR method has an abundant differential power for the molecular typing purposes.