بررسي و تيپ بندي سويه هاي پسودوموناس آئروژينوزاي عامل عفونت بيمارستاني توسط تجزيه و تحليل تعداد توالي هاي متغير تكراري پشت سر هم چند لوكوسي

Survey and typing of Pseudomonas aeruginosa strains causing nosocomial infection using multiple-locus variable number tandem repeat analysis

مقدمه: شناسايي منبع پسودوموناس آئروژينوزاي عامل عفونت بيمارستاني عامل مهم در كنترل عفونت است. هدف از اين مطالعه بررسي و تجزيه و تحليل تعداد تواليهاي متغير تكراري پشت سرهم چند لوكوسي جهت تيپ بندي سويه هاي پسودوموناس آئروژينوزاي عامل عفونت بيمارستاني است. روش كار: مطالعه توصيفي-تحليلي حاضر طي آذر 1394 الي اسفند 1396 در شهر سنندج روي 134 نمونه باليني پسودوموناس آئروژينوزا انجام شد. آزمايش هاي فنوتيپي ميكروب شناسي و PCR جهت تائيد پسودوموناس آئروژينوزا انجام شد. تيپ بندي مولكولي به روش توالي هاي متغير تكراري پشت سرهم چند لوكوس انجام و تجزيه و تحليل آن با استفاده از رسم ماتريكس صفر و يك صورت گرفت. جهت تحليل داده ها از نسخه 12 Stata و آزمون دقيق فيشر و مجذور كاي استفاده شد (0.05>p). يافته ها: درصد سويه هاي پسودوموناس آئروژينوزا كه مرتبط با عفونت بيمارستاني بودند 41.79 % بود. بيشترين نمونه هاي باليني عفونت بيمارستاني مرتبط با تراكئال 51.78 %و كمترين مربوط به خلط و مايع شكمي (هركدام 1.78 %) بود. بين عفونت بيمارستاني و بخش مراقبت ويژه و همچنين با نمونه هاي تراكئال ارتباط معني داري مشاهده شد (0.05>p ). آناليز 10 سويه جداشده از عفونت بيمارستاني وجود 10 الگو با تشابه 72 %را نشان داد. نتيجه گيري: عفونتهاي بيمارستاني مرتبط با پسودوموناس آئروژينوزا و پراكنش اپيدميولوژيكي اين باكتري در مطالعه ما نشان داده شد. بررسي منشأ باكتريهاي علت عفونت بيمارستاني گام مهم در پيشگيري و كنترل آن است.

Background and Aim: Identification of the source of Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) as cause of nosocomial infections is an important step towards infection control. The purpose of this study was to perform multiple-locus variable number tandem repeat survey and analysis for typing of P. aeruginosa as a cause of nosocomial infection. Material and Methods: This descriptive-analytic study included 134 clinical samples of P. aeruginosa in Sanandaj from December 2015 to August 2017. Phenotypic tests and PCR were performed to confirm P. aeruginosa. Molecular typing was carried out by variable number of tandem repeats (VNTR), and analysis was performed using a zero-and-one matrix. Using Stata 12, data were analyzed by chi-square and Fisher's exact tests (p≤0.05). Results: 41.79% of P. aeruginosa strains were associated with nosocomial infections. The highest number of clinical specimens were related to tracheal (51.78%) and the least number associated with sputum and abdominal fluid (each one1.78%). There was a significant relationship between nosocomial infections and intensive care unit (ICU) (p≤0.05). Also nosocomial infections showed a significant relationship with tracheal samples (p≤0.05). Analysis of 10 strains isolated from nosocomial infections showed 10 patterns with a similarity of 72%. Conclusion: Nosocomial infections were related to P. aeruginosa and we showed epidemiological distributions of this bacterium in our study. Identification of the origin of the bacteria responsible for nosocomial infections is an important step in the prevention and control of these infections.