بررسي تنوع ژنتيكي سرده انجير (Ficus L) در ايران با استفاده از نشانگرهاي مولكولي توالي‌هاي تكراري ساده مياني

The Genetic Diversity Survey of the Ficus L. Genus in Iran using Inter Simple Sequence Repeats Markers

انجير به عنوان يك محصول مهم، در چند دهه اخير به دليل بروز تنش­هاي زنده و غير زنده دچار فرسايش ژنتيكي شده است. هدف از اين تحقيق تعيين تنوع ژنتيكي گونه­هاي خودروي سرده Ficus در ايران با استفاده از نشانگر ISSR مي­باشد. جهت انجام اين تحقيق، تعداد 23 نمونه جمعيتي متعلق به گونه ­هاي اين جنس از سراسر كشور جمع آوري و DNA ژنومي آنها از برگ استخراج گرديد. از ميان 18 آغازگر ISSR مورد آزمايش، شش جفت آغازگر كه باندهاي مناسب و قابل تحليل داشت، انتخاب و فرآيند PCR پس از تعيين دماي مناسب براي آنها انجام شد. در مجموع تعداد 83 باند الكتروفورزي PCR توليد شد كه از اين تعداد 78 باند پلي­مورفيك بودند. از ميان آغازگر­هاي استفاده شده، آغازگرهاي AG)8 C، (TG)8 A) و GT)8 C) مناسب‌ترين آغازگر براي كاربرد در مطالعات آتي تشخيص داده شد. بر اساس نتايج به دست آمده از دندرو گرام رسم شده حاصل از آناليز داده­هاي ISSR، 23 جمعيت Ficus در چهار گروه قرار گرفتند. نتايج حاصل از تحليل واريانس مولكولي نشان داد كه بالاترين ميزان فاصله ي ژنتيكي بين جمعيت‌هاي درون گونه‌ها است. نتايج اين تحقيق نشان داد كه تاكسون هاي متعلق به سرده Ficus در ايران از لحاظ تبارزايي بسيار به هم نزديك مي­ باشند و ارتباط توليد مثلي و جريان ژني بين آنها بالا است.

Figs as an important product in recent decades due to biotic and abiotic stresses have been faced to genetically erosion. The aim of this study was to determine the genetic diversity of taxa belonged to Ficus genus using Inter-simple sequence Repeat markers (ISSR). For this purpose, 23 accessions belonging to the fig genus collected from across the Iran country and genomic DNA was extracted from leaves. Out of 18 ISSR primers pairs, six primers pairs selected and PCR process were achieved for them. A total of 83 bands were produced, of which 78 were polymorphic. Using PAUP software, through Neighbor Joining methods, 23 populations of fig were divided in four groups. Among the primers, (AG) 8 C, (TG) 8 A and (GT) 8 C were identified as the most appropriate primers for using in future studies. Based on the results obtained from the analysis of data from ISSR, 23 populations of Ficus were classified into four groups. The results of the analysis of molecular variance (AMOVA) showed that there is no difference between the taxa and the highest genetic distance between populations within species. The results of this study showed that taxa belonging to the Ficus genus in Iran are very closely related phylogentically, and the relationship between reproductive and genetic flow is high.