بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت‌هاي كدوتخم‌كاغذي (Cucurbita pepo var. styriaca) با استفاده از نشانگر‌هاي مولكولي ISSR

Evaluation of Genetic Diversity of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) Populations, Using ISSR Molecular Markers

مطالعه تنوع ژنتيكي در گياهان دارويي، يكي از اهداف مهم به‌نژادي است. پيشرفت هاي اخير در كاربرد واكنش زنجير­ه­اي پليمراز، امكان بررسي افراد يك جمعيت را در تعداد مكان‌هاي ژني بيشتري از ژنوم فراهم ساخته است و از ميان نشانگرهاي مولكولي DNA، نشانگرISSR نيز به طور موفقيت آميزي در مطالعات مختلف تنوع ژنتيكي گياهان استفاده شده است. در اين پژوهش، تنوع ژنتيكي 43 نمونه از 5 جمعيت كدو تخم ­كاغذي و 4 نمونه از 1 جمعيت كدو تنبل كشت شده در كلكسيون دانشگاه شهيد بهشتي توسط 12 نشانگر ISSRبررسي شد. در مجموع 83 نوار قابل امتياز­دهي به­ دست آمد و ميانگين نوارهاي توليدي توسط نشانگرها 6/91 بود و 100 درصد نوار­هاي قابل امتياز­دهي چند شكلي نشان دادند. دندروگرام بر اساس ضريب تشابه جاكارد و روش خوشه ­بندي (CLink (Complete Linkage، ترسيم گرديد و پنج گروه اصلي به­ دست آمد. نتايج به دست آمده از گروه­ بندي با دو روش تجزيه به مختصات اصلي و تجزيه خوشه ­اي نشان داد كه گروه ­بندي ارايه شده توسط دو روش مزبور با يكديگر مشابه بودند. ضريب كوفنتيك محاسبه و 0/97 به­ دست آمد. در مجموع نتايج نشان داد كه برخي از نشانگرهاي ISSR استفاده شده در اين تحقيق، براي مطالعات آينده تنوع ژنتيكي در گونه Cucurbita pepo مفيد است.

Evaluation of genetic diversity in medicinal plants is one of the most important evolutionary and breeding goals. Recent developments in polymerase chain reaction brings the possibility of evaluation the individuals of a population in more sites of genome, and among different DNA molecular markers, the ISSR marker was successfully used in study of the genetic diversity of different plants. The genetic diversity of 43 individuals from five populations of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) and 4 individuals from one population of C. maxima which cultivated in Shahid Beheshti University collection (Tehran, Iran) was investigated using 12 ISSR markers. Totally, 83 scorable bands were produced by ISSR markers and the mean for the produced band for each marker was 6.91 and 100% of scorable bands were polymorphic. Dendrogram was illustrated based on Jaccard coefficient similarity matric and algorithm of Complete Linkage. Based on cluster analysis, individuals of populations divided into five main groups. The results of the grouping through principal coordinate analysis and cluster analysis showed that groupings by the two mentioned methods were consonant with each other and have made a similarity grouping. The cophenetic coefficient was calculated as 0.97. Totally, the results of present study showed that the some of used ISSR markers could be useful for future study of genetic variation in Cucurbita pepo