تايپينگ مولكولي و بررسي حضور ژن‌هاي افلاكس در ايزوله‌هاي ادراري كلبسيلا پنومونيه: مطالعه مقطعي

MOLECULAR TYPING and INVESTIGATING THE PRESENCE OF EFFLUX GENES IN URINARY ISOLATES OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE

پيش‌زمينه و هدف: پمپ‌هاي افلاكس نقش مهمي در ايجاد مقاومت دارويي در كلبسيلا پنومونيه ايفا مي‌كنند. هدف از اين مطالعه، بررسي مقاومت آنتي‌بيوتيكي، حضور ژن‌هاي افلاكس و همچنين تايپينگ مولكولي جدايه هاي باليني كلبسيلا پنومونيه بود. مواد و روش‌ كار: در اين مطالعه توصيفي مقطعي درمجموع، 100 جدايه باليني كلبسيلا پنومونيه از بيمارستان ميلاد تهران جمع‌آوري شد. شناسايي باكتري‌ها بر اساس آزمون‌هاي بيوشيميايي و آزمايش حساسيت ضد ميكروبي مطابق با توصيههاي موسسه استاندارد روشهاي آزمايشگاهي (CLSI) انجام شد. حضور ژن‌هاي tolC، AcrAB، mdtK با استفاده از واكنش زنجيرهاي پليمراز (PCR) و تايپنگ مولكولي با استفاده از روش PCR عناصر تكراري بين ژني (ERIC-PCR) انجام شد. يافته‌ها: نتايج حاصل نشان داد كه 48 درصد ايزوله‌ها مقاومت چند دارويي (MDR) داشتند. بيشترين ميزان مقاومت نسبت به آنتي‌بيوتيك‌هاي آميكاسين (65 درصد) و سفپيم (57 درصد) و كم‌ترين ميزان مقاومت به ترتيب نسبت به آزترئونام (صفر درصد) و فسفومايسين (1 درصد) مشاهده شد. ژن AcrAB با فراواني 96 درصدي، فراوانترين ژن افلاكس در ايزوله ها بود و پس‌ از‌آن ژن‌هاي mdtK با 82 درصد و tolC با 79 درصد قرار داشتند. ERIC-PCR، 16 ژنوتيپ متفاوت را در جدايه هاي كلبسيلا پنومونيه نشان داد. ارتباط معني‌داري بين الگوي اريك و ژن‌هاي پمپ افلاكس در برخي كلونها مشاهده شد (p<0.05). بحث و نتيجه‌گيري: يافته هاي ما شيوع بالاي مقاومت چند دارويي و ژن‌هاي افلاكس را در جدايه‌هاي كلبسيلا پنومونيه نشان داد. سركوب سيستمهاي افلاكس ممكن است در درمان و كنترل عفونتهاي كلبسيلا پنومونيه مقاوم به چند دارو مفيد باشد.

Background & Aims: The efflux pumps play an important role in the development of drug resistance in Klebsiella pneumoniae. The aim of this study was to investigate the antibiotic resistance, and the presence of efflux genes, as well as molecular typing in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae. Materials & Methods: In this cross sectional descriptive study, a total of 100 K. pneumoniae isolates were collected from Milad hospital, Tehran, Iran. Bacterial identification was carried out by biochemical tests and antimicrobial susceptibility testing performed according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. The presence of TolC, AcrAB, MdtK genes were investigated using polymerase chain reaction (PCR) and molecular typing was performed according to the enterobacterial repetitive intergenic consensus -polymerase chain reaction (ERIC-PCR). Results: The results showed that 48% of isolates were multidrug resistant (MDR). The highest rate of resistance was observed against amikacin (65%) and the lowest resistance was found in aztreonam and fosfomycin (1%). The occurrence of AcrAB gene (96%) was the highest, followed by mdtK (82%) and tolC (79%). ERIC-PCR revealed 16 different genotypes among K. pneumoniae isolates. There was a significant association between ERIC-PCR pattern and efflux pump genes in some clonal types (p<0.05). Conclusion: Our findings indicated the high prevalence of multidrug resistance and efflux genes in Klebsiella pneumoniae isolates. The strategy for suppressing these efflux systems may be useful in the treatment and control of the multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae.