عنوان مقاله :
بررسي گسترده ژنومي خانواده ژن هاي پاسخ گو به هورمون اكسين (ARF) در لوبيا
عنوان به زبان ديگر :
Genome-wide analysis of the auxin response factor (ARF) gene family in Phaseolus vulgaris
پديد آورندگان :
فاطمي، سهيلا دانشگاه كردستان، سنندج، ايران , ميرزايي، خالد دانشگاه كاتوليك لوون - دانشكده زمين و زندگي - مركز تحقيقات تنوع، 1348 بلژيك , كمانگر، محمد صديق دانشگاه كردستان، سنندج، ايران
كليدواژه :
لوبيا , خانواده ژني , اكسين , ARF
چكيده فارسي :
اكسين نقش مهمي در تنظيم مراحل مختلف رشد و نمو گياهان دارد. مطالعات نشان داده است كه اكسين اين فرآيندها را با استفاده از ژن هاي پاسخ گو به اكسين (ARF) تنظيم مي كند. با توجه به نوع دومين مياني، پروتئين ARF به عنوان يك فاكتور رونويسي با اتصال به ژن هاي هدف باعث سركوب و يا تحريك بيان اين ژن ها مي شود. ژن هاي ARF در چند گونه مختلف گياهي با استفاده از روش هاي مولكولي مورد مطالعه قرار گرفته اند، با اين حال براي درك بهتر مكانيسم اين پروتئين ها نياز به مطالعات بيشتري در گياهان است. در اين مطالعه با استفاده از روش هاي محاسباتي 27 ژن ARF شناسايي شد كه در قسمت هاي مختلف كروموزوم هاي لوبيا پراكنده هستند. بررسي درخت فيلوژنتيكي نشان داد اين توالي ها در چهار گروه مجزا قرار دارند بدون اينكه در بين اين توالي ها مضاعف شدگي مشاهده شود. بيان ژن هاي ARF باتوجه به نوع ژن و بر اساس نوع بافت به ترتيب به پنج و دو گروه تقسيم شد. ژن هاي ARF در بافت هاي برگ، سه برگچه هاي جوان، ساقه، غلاف هاي رسيده و غلاف هاي جوان در مقايسه با ساير بافت هاي ديگر بيان بيشتري داشتند. از كل توالي هاي ARF مورد بررسي، تعداد 9 و 17 توالي به ترتيب به عنوان محرك و سركوب كننده بيان ژن شناسايي شدند.
چكيده لاتين :
Auxin has an important role in the various stages of
plants growth and development. Studies have shown
that auxin regulates these processes by auxin
responsefactors (ARF) family. ARF proteins due to
their central domain, mediate the cellular response to
the auxin by activating or repressing the expression of
downstream genes. ARF genes in several different plant
species have been studied by molecular methods
however to better understand the mechanisms of these
proteins more studies are needed. In this study with
computational methods, we found 27 ARF proteins,
which they were scattered on the different parts of
Phaseolus vulgaris chromosomes. The phylogenetic
analysis of these sequences revealed they were divided
into four different classes without any sign of geneduplication
between them. ARF genes expression
according to the types of gene and based on the types of
tissue respectively showed that they group into the five
and two classes. In comparing with other tissues, ARF
genes in leaf, young trifoliates, stems, mature pods and
young pods tissues have a high level of expression. Of
the 27 ARF Phaseolus vulgaris sequences surveyed in
this study, nine ARF proteins were gene activator and
17 ARF proteins were gene suppressor.
عنوان نشريه :
زيست فناوري گياهان زراعي
عنوان نشريه :
زيست فناوري گياهان زراعي
