تاثير چند شكلي دو جايگاه ژن PPARGC1α روي صفات توليد شير گاو براون سوئيس

The Influence of two Polymorphic Sites of PPARGC1α Gene on Milk Production Traits in Brown Swiss Cattle

اكثر صفات مهم در دامپروري تحت تاثير جايگاه ­هاي صفات كمي و اثرات محيطي قرار مي­ گيرند. ژن PPARGC1α عضوي از خانواده فعال ­كننده­ هاي كمك رونويسي مي­باشد كه نقش اساسي در تنظيم هموستازي انرژي دارد. در اين تحقيق از 100 راس گاو براون سوئيس نمونه خون گرفته شد و DNA به روش نمكي از خون كامل استخراج گرديد. دو جايگاه چندشكلي تك نوكلئوتيدي A/C و T/C به ترتيب واقع در ناحيه غيرقابل ترجمه 3َ و اينترون 9، با استفاده از روش PCR -RFLP تعيين ژنوتيپ شدند. ارزش اصلاحي صفات توليد شير، درصد چربي و درصد پروتئين شير با مدل 1 نرم­افزار DFREML به­ طور جداگانه پيش ­بيني شد. ارتباط چند شكلي­ هاي مدنظر با ارزش اصلاحي صفات در سطح معني ­داري 5% با نرم ­افزار آماري SAS بررسي شد. فراواني ژنوتيپ AA، AC و CC در جايگاه PPARGC1α-A968C به­ ترتيب 0/593، 0/358 و 0/022و فراواني آللي A و C به ترتيب 0/786 و 0/214 محاسبه شد. در جايگاه PPARGC1α-T19C فراواني ژنوتيپ TT، TC و CC به ترتيب 0/164، 0/428و 0/407 و فراواني آللي T و C به ­ترتيب 0/379 و 0/621 محاسبه گرديد. آزمون كاي- مربع بيان­گر تعادل جمعيت براي هر دو جايگاه بود اگرچه در بررسي جداگانه و توام چندشكلي­ هاي ژن PPARGC1α با يك ديگر هيچ گونه ارتباط معني ­داري بين ارزش اصلاحي صفات توليد شير، درصد چربي و درصد پروتئين و اين ژنوتيپ­ ها يافت نشد، اما افزايش تعداد نمونه­ ها براي انجام آناليزهاي آماري دقيق ­تر و كاهش واريانس خطا، توصيه مي­ شود.

The most important traits of animal are affected by quantitative trait loci and environmental effects. Peroxisome proliferator’s active receptor gamma co activator 1 alpha (PPARGC1A) gene is a member of transcription co activators family, which plays a central role in cellular energy hemostasis regulating. In this study, blood samples were collected from hundred Brown Swiss cow and DNA was extracted from whole blood by modified salting out procedure. Two SNP positions, one located in the 3́-untranslated region (A/C) and the other one in iron 9 of PPARGC1A-T19C were genotyped by PCR-RFLP. Breeding values were individually predicted for milk production, fat and protein milk percent traits by DFREML model one. Association between polymorphisms and breeding values were investigated by SAS at 5% significant level. Genotype frequencies of AA, AC and CC genotypes at PPARGC1a-A968C were 0.593, 0.385 and 0.022, as well as, the allele frequencies of A and C were 0.786 and 0.214, respectively. Genotype frequencies of TT, TC and CC for PPARGC1a-T19C were 0.165, 0.428 and 0.407 and the allele frequencies of T and C were 0.379 and 0.621, respectively. Chi-square test of the both SNPs indicated Hardy-Weinberg expectations (P<0.05). In the both separated and common analyze of polymorphisms, there was no significant associations between genotypes of polymorphisms and breeding values of milk production, fat and protein percent traits, however, increasing the samples are recommended for more precise of statistical analysis and decreasing the mean square of error