بررسي خصوصيات فنوتيپي و تنوع ژنتيكي جدايه هاي Ralstonia solanacearum عامل بيماري پژمردگي باكتريائي سيب زميني جداشده از استان كردستان

Phenotypic and genetic properties of Ralstonia solanacearum strains, the causal agent of bacterial wilt of potato isolated from Kurdistan province

ويژگي هاي فنوتيپي و تنوع ژنتيكي 24 جدايه باكتري Ralstonia solanacearum عامل بيماري پژمردگي باكتريائي سيب زميني جدا شده از مناطق مختلف استان كردستان مورد بررسي قرار گرفت. براساس خصوصيات فيزيولوژيك و بيوشيميائي، 19جدايه R. solanacearum بعنوان بيووار 2 تشخيص داده شدند. پنج جدايه، خصوصيات فنوتيپي بيووار 3 را دارا بودند. صحت تشخيص تمامي جدايه ها در سطح گونه توسط واكنش زنجيره اي پليمراز و با استفاده از آغازگرهاي 759/760 اختصاصي گونه مورد تاييد قرار گرفت. در مطالعه جدايه ها با استفاده از روش (Multiplex PCR (Pmx تمامي جدايه هاي تشخيص داده شده تحت عنوان بيووار 2 با تكثير باندهائي با اندازه تقريبي 282 و 372 جفت باز در فيلوتيپ II قرار گرفتند. پنج جدايه با خصوصيات فنوتيپي شبيه به بيووار3، در واكنش Pmx باند اختصاصي گونه به اندازه تقريبي 282 جفت باز به اضافه باند با اندازه تقريبي 191 جفت باز تكثير نمودند كه اختصاصي هيچكدام از گروه هاي فيلوتيپي نمي باشد. نوع ژنتيكي جدايه ها به روش rep-PCR و با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي REP، ERIC و BOX مورد بررسي قرار گرفت. آناليز تركيبي داده با استفاده از هرسه آغازگر به روش UPGMA و براساس ضريب تشابه دايس نشان داد كه جدايه ها در سطح تشابه 43% به 5 گروه قابل تفكيك هستند. ارتباط مشخصي بين گروه بندي بدست آمده و منطقه جغرافيائي جدايه ها مشاهده نشد. نتايج حاصل از اين تحقيق نشاندهنده تنوع ژنتيكي در جدايه هاي R. solanacearum جداسازي شده از استان مورد مطالعه مي باشد.

Phenotypic properties and genetic diversity of 24 strains of Ralstonia solanacearum causing bacterial wilt of potato plants isolated from various locations in Kurdistan province was investigated. According to physiological and biochemical properties, 19 and 5 of isolates were identified as R. solanacearum biovar 2 and 3, respectively. Identification of isolates was further confirmed by PCR using 759/760 primers specific to R. Solanasearum. Based on multiplex PCR, all strains identified as biovar 2 were belonging to phylotype II. In multiplex PCR, strains identified as biovar 3 produced R. solanacearum species-specific fragment but failed to produce expected phylotype-specific amplicon. Genetic diversity of selected strains was investigated by rep-PCR fingerprinting using REP, ERIC and BOX primers. UPGMA analysis of combined data obtained from rep-PCR fingerprint pattern using Dice,s coefficient revealed the strains could be separated into 5 groups at a similarity level of approximately 43%. There was no direct relationship between geographic locations of strains and grouping. Obtained results demonstrated the existence of a genetic diversity among R. solanacearum strains causing bacterial wilt disease of potato in Kurdistan province.