شناسايي واريانت‌هاي ژنتيكي در لاين‌آرين و بررسي عملكرد آنها با استفاده از توالي‌يابي‌كل ژنوم

مطالعه حاضر، اولين پژوهش براي شناسايي واريانت‌هاي ژنتيكي در لاين‌ آرين با اطلاعات توالي‌يابي كل ژنوم است. مطالعه خصوصيات لاين‌ آرين در سطح ژنوم، مي‌تواند تفاوت‌هاي ژنتيكي آن را در ارتباط صفات مهم اقتصادي از جمله رشد شرح دهد. در اين پژوهش، از اطلاعات توالي كل ژنوم سه قطعه مرغ آرين استفاده شد. نتايج نشان داد كه 63866 واريانت بين نمونه‌ها مشترك است كه از اين تعداد، 17604 واريانت به عنوان واريانت جديد براي اولين بار در اين پژوهش گزارش شدند. همچنين، 604 واريانت در مناطق كدكننده ژنوم وجود دارند كه از اين تعداد، 204 واريانت منجر به تغيير در نوع آمينواسيدي پروتئين‌ها مي‌گردند. با توجه به مهم بودن كيفيت پروتئين جيره براي رشد و افزايش وزن براي طيور، نتايج ژن آنتولوژي نشان داد كه مسير كاتابوليسم پروتئين‌ها و مسيرهاي تغييرات پس از ترجمه‌ي پروتئين‌هاي مرتبط با رشد داراي اهميتي دوچندان هستند. همچنين، ژن‌هاي كانديدايSMURF2 و SUMO1 براي اين مسيرهاي بيولوژيك پيشنهاد شد. يكي ديگر از نتايج قابل توجه ژن آنتولوژي، معني‌دار شدن مسيرهاي پاسخ به تنش بود. در لاين آرين به دليل انتخاب شديد براي دستيابي به پيشرفت ژنتيكي بالا در صفات رشد، وجود تنش اجتناب‌ناپذير است. بنابراين، معني‌دار شدن مسيرهاي پاسخ به تنش، مي‌تواند نشان دهنده اهميت اين مسيرها در ارتباط با عملكرد مطلوب باشد.