عنوان مقاله :
كنكاش بيوانفورماتيكي ريزRNAهاي bta-mir-146a ، bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181 و bta-mir-16a در مسيرهاي پيامدهي سلولي ورم پستان درگاو شيري
پديد آورندگان :
بيرانوند ، زهرا دانشگاه گيلان , قادري زفره يي ، مصطفي - گروه علوم دامي , ميرحسيني ، ضيا الدين - گروه علوم دامي , حسيني مقدم ، حسين - گروه علوم دامي , فاضلي ، آرش - گروه زراعت و اصلاح نباتات
كليدواژه :
بيوانفورماتيك , ريز RNA , مسير پيامرساني سلولي , , ورم پستان , KEGG
چكيده فارسي :
هدف: كنكاش مسيرهاي پيامدهي در بيماريهايي مثل ورم پستان در گاو شيري كه بيشتر تحت تاثير فرايندهاي فراژنتيك هستند، ضروري به نظر ميرسد. مواد و روش ها: در اين پژوهش 5 مولكول ريزRNA كانديد با شماره دسترسيهاي bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181، bta-mir-146a و bta-mir-16a در منابع شناسايي و استخراج شدند و با استفاده از پايگاه داده Mirtarbase و پايگاه داده Targetscan به ترتيب ژنهاي هدف تاييد شده و پيشبيني شده براي هر يك از ريزRNAهاي بالا استخراج شدند. سپس بيان ژنهاي هدف پيشبيني شده و تاييد شده براي هر يك از ريزRNAهاي بالا در بافت غدد پستاني در پايگاه NCBI بررسي شدند. علاوه بر اين با استفاده از نرم افزار DAVID، مسيرهاي پيامرساني سلولي در KEGG مشخص شدند. نتايج: بر اساس نتايج بدست آمده مشخص شد كه ريز bta-mir-146a RNAاز طريق تاثير بر 7 پروتئين، و ريز RNA bta-mir-223 از طريق تاثير بر 11 پروتئين و ريز bta-mir 21-5p RNA از طريق تاثير بر 9 پروتئين در مسيرهاي پيامدهي سلولي مختلفي درگير هستند، و لذا احتمالا در بيماري ورم پستان گاو شيري نقش دارند. همچنين نتايج نشان داد كه دو ريز bta-mir-181 RNAو bta-mir-16a در مسيرهاي پيامدهي مهمي مثل GnRH signaling pathway، Estrogen signaling pathway، Progesterone-mediated oocyte maturation، Oxytocin Signaling Pathway و MAPK Signaling Pathway نقش مهمي را بازي ميكنند. نتيجه گيري: اين پژوهش نشان ميدهد كه ريزRNAهاي مورد بررسي ميتوانند به عنوان نشانگرهاي مولكولي، در علت يابي ملكولي بيماري ورم پستان گاو شيري نقش مهمي ايفا كنند.
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي