بهبود ارزيابي ژنومي گاوهاي هلشتاين با استفاده از ماتريس روابط ژنومي بر پايه اطلاعات هاپلوتايپ ها

امروزه استفاده از اطلاعات هاپلوتايپ¬ به منظور تخمين ارزش ¬اصلاحي ژنومي (GEBV) با صحت و دقت بالاتر مورد توجه قرار گرفته است. استفاده از شباهت بين هاپلوتايپ ها نسبت به مستقل در نظر گرفتن اثرات هاپلوتايپ¬ها مي¬تواند منجر به قابليت پيش¬گويي بالاتر برآوردهاي ژنومي ¬گردد. هدف از اين مطالعه بررسي صحت و اريبي GEBV به روش بهترين برآورد نااريب خطي ژنومي (GBLUP) با استفاده از ماتريس روابط خويشاوندي ژنومي بر پايه اطلاعات نشانگرهاي چندشكلي تك نوكلئوتيدي (GSNP) و هاپلوتايپ¬ (GHAP) و ماتريس هيبريد شامل اطلاعات هاپلوتايپ¬ها وSNPها (GSNP,HAP) بود. ماتريس¬هاي روابط خويشاوندي ژنومي با استفاده از تراشه k50 براي جمعيت گاو شيري هلشتاين آمريكاي شمالي براي صفات توليد چربي شير، توليد شير، نمره سلول بدني، تيپ و روزهاي باز تشكيل گرديد. مقادير صحت GEBV با استفاده از ماتريس GSNP و GHAP به ترتيب از 49/0 (روزهاي باز) تا 72/0 (توليد چربي شير) و 50/0(روزهاي باز) تا 73/0 (توليد چربي شير) متغير بود. استفاده از ماتريس GHAP در مقايسه با ديگر ماتريس هاي مورد بررسي در اين مطالعه منجر به برآوردهاي نااريب¬تري در تمام صفات شد. استفاده از ماتريس GHAP نسبت به GSNP موجب 6 تا 15 درصد كاهش اريبي برآوردها در صفات مختلف گرديد. يكي از دلايل بهبود اريبي برآوردها مي تواند برآورد بهتر واريانس ژنتيكي در سطح جمعيت توسط هاپلوتايپ نشانگرها نسبت به نشانگر انفرادي باشد. بر اساس نتايج حاضر ماتريس GHAP مي تواند جايگزين مناسبي براي GSNP در ارزيابي هاي ژنومي به منظور دستيابي به برآوردهاي ارزش اصلاحي نااريب تر و دقيق تر باشد.