عنوان مقاله :
جداسازي، تعيين خصوصيت و تحليل بيان ژن 4’OMT2 گياه دارويي شقايق
پديد آورندگان :
سهرابي ، محسن - دانشكده كشاورزي , اسماعيلي ، احمد - دانشكده كشاورزي , نظريان فيروزآبادي ، فرهاد - دانشكده كشاورزي , سميعي ، كامران - دانشكده كشاورزي
كليدواژه :
بيان ژن , O -متيل ترانسفراز , توالي ژنوميك , شقايق , SRA
چكيده فارسي :
گياه شقايق (Papaver somniferum L.) يكي از مهمترين گياهان دارويي جهان بوده و چندين آلكالوئيد بنزيل ايزوكوئينوليني دارويي مهم را توليد ميكند. در اين پژوهش ژن 4’OMT2 (3′-hydroxy-N-methylcoclaurine 4′-O-methyltransferase) از اين گياه جداسازي، تعيين توالي و تعيين خصوصيت شد. پس از تكثير توالي كدكننده و ژنوميك ژن 4’OMT2با استفاده از PCR، اين قطعات در پلاسميد pTZ57R/T همسانهسازي و تعيين توالي شدند. نتايج توالييابي قطعاتي با طول 1074 و 1189 جفت بازي را بهترتيب براي توالي كدكننده و ژنوميك نشان داد. براي اولين بار در اين گياه، نتايج وجود يك اينترون با طول 115 جفت باز را در توالي ژنوميك ژن 4’OMT2نشان داد. ژن جداسازي شده از ژنوتيپ ايراني با همساني بسيار بالايي به ژن 4’OMT2جنس شقايق شباهت داشت و با همساني بيشتر از 67 درصد به گياهان راسته آلاله سانان شبيه بود. بررسيهاي بيوانفورماتيكي بيشتر نشان داد كه ژن 4’OMT2آنزيمي پايدار را توليد ميكند كه بدون سيگنال پپتيد بوده و در سيتوپلاسم تجمع پيدا ميكند. براي بررسي آناليز بيان ژن، پنج كتابخانه از دادههاي SRA (نوع mRNA) گياه شقايق مربوط به ترانسكريپتوم جوانه گل، برگ، ميوه در حال نمو، ساقه و ريشه از پايگاه SRA دريافت و بيان ژن جداسازي شده 4’OMT2در آنها با استفاده از نرمافزار IDEG6 و آزمونهاي آماري بررسي شد. نتايج نشان داد كه اين ژن داراي بيان متفاوتي در بافتهاي مختلف گياه شقايق بوده و بيشترين ميزان بيان را در بافت ساقه دارد. شناسايي توالي كدكننده ژنهاي بيوسنتزي و بررسي خصوصيات آنها اولين قدم در دستورزي ژنتيكي و بهرهگيري در مهندسي متابوليك است. در اين پژوهش براي اولين بار توالي كدكننده كامل ژن 4’OMT2از گياه شقايق جداسازي شد و وجود يك اينترون در ساختار آن مشخص و اثبات شد.
عنوان نشريه :
تحقيقات ژنتيك و اصلاح گياهان مرتعي و جنگلي ايران
عنوان نشريه :
تحقيقات ژنتيك و اصلاح گياهان مرتعي و جنگلي ايران