عنوان مقاله :
مطالعه فيلوژني و بيان ژن هاي پلي آمين اكسيداز (PAO) در ذرت (Zeamays L.)
پديد آورندگان :
عابدي ، امين - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , سوهاني ، محمد مهدي - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , شيرزاديان خرم آباد ، رضا - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي
كليدواژه :
بيوانفورماتيك , تكامل , ساختار ژن , مضاعف شدگي , همولوگ
چكيده فارسي :
پلي آمين ها به وسيله آنزيمهاي آمين اكسيداز شامل آمينواكسيدازهاي حاوي مس (CuPAO) و پلي آمين اكسيدازهاي (PAO) وابسته به FAD به صورت اكسيداتيو دآمينه مي شوند. شواهد زيادي مبني بر نقش ضروري پلي آمين اكسيدازها در رشد و نمو گياهان مانند اندام زايي و پيري و نيز پاسخ به تنش هاي زيستي و غيرزيستي وجود دارد. در دسترس قرار گرفتن توالي ژنوم ذرت فرصت بسيار مناسبي براي مستندسازي، گروهبندي و نيز مطالعات ژنوميكس مقايسه اي مهيا ساخته است. در اين مطالعه از طريق آناليزهاي بيوانفورماتيك، ZmPAO1تاZmPAO9 در ژنوم ذرت شناسايي شد. آناليز فيلوژنتيك نشان داد كه ژنهاي ZmPAO همانند اورتولوگ آنها در آرابيدوپسيس و برنج به سه گروه اصلي تقسيم مي شوند. ضمن اينكه ژن هاي PAO ذرت ارتباط تكاملي نزديك تري با ژن هاي برنج در مقايسه با آرابيدوپسيس دارند. مطالعه ساختار ژني نشان داد كه تعداد اينترونهاي ZmPAO از صفر تا نه متغير است و روي چهار كروموزوم از ده كروموزوم ذرت قرارگرفتهاست. مضاعف شدگي تاندوم و سگمنتال موجب افزايش تعداد اعضاي خانواده ژني PAO در ذرت شده اند. با استفاده از داده هاي ريزآرايه در دسترس، پروفايل رونوشتبرداريژن هايZmPAO در فرآيندهاي رشد و نمو ذرت ارزيابي و نتايج نشان دهنده نقش احتمالي آن ها در تنظيم نمو بود. نتايج اين مطالعه اطلاعات پايهاي را ارايه كرد كه براي مطالعات عملكردي آينده در مورد فعاليت ژن هاي ZmPAO در بافت ها، نقش آنها در نمو و نيز در پاسخ به تنش ها مفيد و موثر است.
عنوان نشريه :
تحقيقات غلات
عنوان نشريه :
تحقيقات غلات