مقايسه پروفايل تنوع CNV در ژنوم گوسفند با گاو هلشتاين

هدف از اين پژوهش مقايسه CNV در تعدادي از نژاد هاي گوسفند ايتاليا با گاو هلشتاين بود. از 580 راس گاو نر هلشتاين و 360 راس گوسفند نمونه خون تهيه و  DNAآن استخراج شد. ژنوتيپ چند شكلي هاي تك نوكلئوتيدي سراسر ژنوم با تراشه 50k گاوي و گوسفندي در هر دو گونه تعيين شد. با استفاده از نرم افزار PennCNV تعداد 904 تنوع با ميانگين طول kb 154.7 و ميانه kb 103.7 در گوسفند و 744 مورد با ميانگين طول kb 213.7 و ميانه kb 124.5 در گاو شناسايي شد. كل طول اين تنوع در ژنوم گوسفند Mb 8.5 و در ژنوم گاو Mb 80 بود. پس از تركيب نواحي مشابه تعداد 35 ناحيه تنوع پر تكرار در ژنوم گوسفند و 141 مورد در ژنوم گاو شناسايي شد، فقط 20 درصد نواحي CNV در ژنوم نژاد هاي گوسفند با ژنوم گاو هلشتاين همپوشاني داشت. علاوه بر اين، نواحي اين تنوع در ژنوم گوسفند با 40 ژن مرجع و 62 QTLدر ژنوم گاو، و 110 ژن مرجع در ژنوم انسان بطور كامل يا جزئي همپوشاني داشت. توزيع تنوع ها در هر دو گونه در نواحي ساب تلومريك و پري سانترومريك بيشتر بود. بر اساس اين نتايج، شايد بتوان از روي پيوستگي اين تنوع با نواحي ژني در ژنوم گاو ژن ها و QTL هاي ژنوم گوسفند را شناسايي نمود. براي كسب نتايج دقيق تر مطالعات بيشتري نياز است.