عنوان مقاله :
شناسايي مولكولي استرين C ويروس واي سيب زميني (Potato virus Y) از گوجه فرنگي در استان مازندران
پديد آورندگان :
مرادي ، زهره - گروه گياهپزشكي , مهرور ، محسن - گروه گياهپزشكي , نظيفي ، احسان - گروه زيست شناسي
كليدواژه :
آناليز فيلوژنتيكي , ايران , پوتيويروس , ژن CI
چكيده فارسي :
ويروس واي سيب زميني ( Potato virus Y,PVY) عضو تيپ جنس Potyvirus ، يكي از مهم ترين عوامل بيمارگر در گياهان خانواده سولاناسه مي باشد. در سال زراعي 1392 تعداد 38 نمونه مشكوك به آلودگي ويروسي از مزارع گوجه فرنگي استان مازندران جمع آوري و پس از بررسي با آغازگرهاي دژنره پوتي ويروس ها، تعداد 9 نمونه آلوده به پوتي ويروس تشخيص داده شدند. پس از همسانه سازي و توالي يابي نمونه هاي آلوده، چهار جدايه با علائم موزائيك، پيسكي و بدشكلي به عنوان PVY شناخته شدند كه به دليل شباهت بالا، دو جدايه به نام هاي GB و GRA انتخاب گرديد. آناليز فيلوژنتيكي جدايه هاي ايراني به همراه 115 جدايه ديگر موجود در بانك ژن در ناحيه ژني CI (Cylindrical inclusion) نشان داد كه تمام جدايه هاي مقايسه شده در سه گروه اصلي (I، II، III) قرار گرفته و جدايه هاي ايراني همراه با جدايه هايي از كشورهاي ايتاليا، استراليا، هلند، فرانسه، اسپانيا و اروگوئه كه همگي از نژادC مي باشند در زير گروه IF قرار مي گيرند. جدايه هاي ايراني PVYGB و GRA در زيرگروه IF يكsublineage جداگانه را تشكيل دادند و داراي بيشترين شباهت (96.5-95.7 درصد) با جدايه اسپانيا (LYE84.2) و كمترين شباهت (819.3/80 درصد) با جدايه ژاپن (T13) و كانادا (Tu_660) در سطح نوكلئوتيدي بودند. در سطح آمينواسيدي نيز جدايه هاي ايراني بيشترين شباهت (99.1 درصد) را با جدايه اسپانيا (LYE84.2)، ايتاليا (Foggia) و اروگوئه (Tannat) و كمترين شباهت (93.4 درصد) را با جدايه ژاپن (T13) داشتند. همچنين تشابه توالي نوكلئوتيدي و آمينواسيدي اين دو جدايه با يكديگر به ترتيب 98.4 و 100 درصد تعيين گرديد. اين اولين گزارش از وجود نژاد PVY C از گياه گوجه فرنگي در استان مازندران و ايران مي باشد.
عنوان نشريه :
حفاظت گياهان
عنوان نشريه :
حفاظت گياهان