تشخيص مولكولي ژن‌هاي القاء شده گياه سيب زميني دخيل در دفاع عليه باكتري Ralstonia solanacearum

Molecular characterization of defense-related genes, induced against Ralstonia solanacearum in potato

با استفاده از تكنيك cDNA-AFLP واكنش مولكولي رقم حساس (مارفونا) و رقم متحمل (الس) در گياه سيب زميني (Solanum tuberosum) و ژنوتيپ مقاوم (S. phureja) براي شناسايي ژن­هاي دخيل در مكانيسم ­هاي دفاعي مورد بررسي قرار گرفت. بيان ژن­هاي مرتبط با دفاع در چهار زمانهاي 0، 2، 4 و 7 روز بعد از آلوده سازي ريشه گياهان با باكتري R. solanacearum در شرايط درون شيشه ­اي بررسي گرديد. حدود 2820 قطعه مشتق از رونوشت مشاهده شد كه در اين ميان 206 قطعه الگوهاي بيان متفاوتي نشان دادند. در مجموع 20 قطعه با بيشترين اختلاف، توالي­يابي شدند و همولوژي آنها با ژن­هاي شناخته شده قبلي در بانك­ ژن بررسي گرديد. اين ژن­ها تشابه قابل توجهي با برخي ژن­هاي درگير در فرايند­هاي فيزيولوژيكي واكنش به استرس ­ها، دفاع، ژن‌هاي ساختاري وژن‌هاي دخيل در نسخه ­برداري، سنتز و بسته­ بندي پروتئين داشتند. تغيير بيان اين ژن­ها در S. phureja نسبت به S. tuberosum پس از آلودگي با R. solanacearum بيشتر بود.

Molecular responses of susceptible (Marfona) and tolerant (Els) cultivars of Solanum tuberosum, and a resistant genotype of S. phureja were comparatively studied using a cDNA-AFLP technique to identify candidate genes involved in defense mechanisms against Ralstonia solanacearum. Transcriptional changes were studied at 0, 2, 4 and 7 days post inoculation of the plants by R. solanacearum through root inoculation under in vitro conditions. Of the 2820 transcript derived fragments (TDFs) detected, 206 TDFs showed variable patterns. In total 20 TDFs with stronger differential induction were sequenced. These TDFs showed significant homologies with the genes involved in physiological processes, stress responses, cell structure, defense, transcription and protein synthesis/folding. Approximately 5% of the sequenced TDFs were identified with unknown function. Induction of a higher number of genes was altered in response to R. solanacearum in S. phureja compared to S. tuberosum.