تنوع آنالوگ‌هاي ژن‌هاي مقاومت به بيماري در ارقام مقاوم و حساس به زنگ گندم نان

Diversity of Resistance Gene Analogues in Rust Resistance and Susceptible Bread Wheat Varieties

بيماري‌هاي قارچي به خصوص زنگ‌هاي زرد و قهوه‌اي باعث كاهش عملكرد گندم در ايران و جهان مي‌شوند. در اين مطالعه، تنوع ژنتيكي 20 رقم گندم نان با پاسخ متفاوت به زنگ‌هاي قهوه‌اي و زرد با استفاده از آغازگرهاي طراحي شده براساس نواحي حفاظت شده ژن‌هاي مقاومت به بيماري بررسي شد. الگوي نواري نشانگرهاي چند شكل به صورت غالب امتيازدهي و تعداد نوار تكثير شده و درصد چند شكلي تعيين گرديد. علاوه بر اين، براي هر تركيب آغازگري، پارامترهاي محتواي اطلاعات چند شكلي (PIC) و شاخص نشانگر (MI) محاسبه شد. از مجموع 11 ﺁغازگر منفرد و جفت، پنج تركيب ﺁغازگري به همراه يك آغازگر منفرد تكثير مناسب و قابل امتيازدهي توليد كردند. حداكثر و حداقل ميانگين PIC به ترتيب مربوط به آغازگر LLOOP-1 و جفت آغازگر H2016-H2020 با ميزان 0.50 و 0.28 بود. جفت آغازگرهاي H2016-H1146 و H2016-H2020 با ميانگين 4.80 و 2.84 به ترتيب حداكثر و حداقل MI را داشتند. تجزيه خوشه‌اي براساس الگوريتم Neighbor-Joining و ضريب فاصله تكاملي P-distance، ارقام مورد مطالعه را به چهار گروه منتسب كرد و اين گروه‌بندي با پاسخ به زنگ زرد ارقام مطابقت داشت. در تجزيه به بردارهاي اصلي، پراكنش ارقام براساس دو بردار اصلي اول، چهار گروه حاصل از تجزيه خوشه‌اي را تأييد

Fungal diseases, especially leaf and stripe rusts are wheat yield reducing factors in Iran and the world. In this study, genetic diversity of 20 wheat varieties with different response to leaf and stripe rusts were studied using primers designed based on the conserved regions of plant disease resistance genes. The banding patterns of polymorphic markers were scored as dominant and number of amplified bands and percentage of polymorphism were determined. In addition, for each primer combination, polymorphic information content (PIC) and marker index (MI) were calculated. Out of the 11 used single primers and primer combinations, five primer combinations and a single primer produced scorable amplification. The maximum and minimum of PIC were observed for LLOOP-1 and H2016-H2020 primer combination with mean value of 0.50 and 0.28, respectively. The primer combinations of H2016-H1146 and H2016-H2020 with mean values of 4.80 and of 2.84, had minimum and maximum of MI, respectively. Cluster analysis based on Neighbor-Joining algorithm and evolutionary P-distance coefficient assigned the varieties into four groups which were in agreement with their response to yellow rust. In principal coordinate analysis, the scatter plot of varieties based on two first coordinates confirmed the groups obtained from cluster analysis.