بررسي چندشكلي ناحيه 5-Flanking ژن Pit-1 و ارتباط آن با صفات رشد در غاز بومي ايران

Investigation of Polymorphism in 5- Flanking Region of Pit-1 gene and its association with growth traits in Iranian native Goose

هدف از اين تحقيق، مطالعه چندشكلي در ناحيه 5- Flanking ژن Pit-1 و ارتباط آن با صفات رشد در غاز بومي ايران با روش PCR-SSCP مي‌باشد. براي اين منظور در اين پژوهش از 160 قطعه غاز مركز اصلاح نژاد آذربايجان شرقي، واقع در شهرستان ملكان خونگيري انجام شد. براي استخراجDNA از روش بايلس استفاده گرديد و واكنش زنجيره‌اي پلي مراز جهت تكثير قطعه 241 جفت بازي ناحيه 5- Flanking ژن Pit-1 انجام گرفت. روش تفاوت فرم فضايي رشته‌هاي منفرد(SSCP) جهت شناسايي چندشكلي در نمونه‌ها بكار برده شد. الكتروفورز عمودي نمونه‌ها روي ژل آكريلاميد 8% به مدت 18 ساعت و با اختلاف پتانسيل 120 در دماي 4 درجه سانتيگراد صورت گرفت. رنگ آميزي ژل با استفاده از نيترات نقره انجام گرديد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه ناحيه مورد بررسي اين ژن چندشكل است. كه در نتيجه آن الگوهاي ژنوتيپي 4،3،2،1 به‌ ترتيب با فراواني 312/0، 364/0، 070/0، 254/0 درصد مشاهده شد. آناليز واريانس صفات با استفاده از نرم افزار SAS رويه GLM انجام گرفت. براساس نتايج بدست آمده، بين جنس‌هاي مختلف اختلاف معني‌داري مشاهده شد. و همچنين بين الگوهاي مشاهده شده با وزن بدن در 30 روزگي اختلاف معني‌داري يافت شد، ولي بين اين الگو‌ها و وزن بدن در 60، 90 و 150 روزگي اختلاف معني‌داري مشاهده نشد.

The objective of this study was detection of polymorphism in 5- Flanking region of Pit-1 gene and its association with growth traits in Iranian native Goose by PCR-SSCP method. For this purpose, blood samples were taken from 160 Goose from East Azerbaijan breeding station that located in Malekan. DNA was extracted from whole blood using the Bailes method and polymerase chain reactions were performed for amplification of 241 bp fragment containing in 5- Flanking region of Pit-1 gene.Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) was used for genotyping. For this purpose, vertical electrophoresis of PCR products was performed on 8% acrylamide gel, at 120 V, for 18 h at 4 C˚. Silver-staining of gels is used to detect, resulted four genotypic patterns of 1, 2, 3 and 4 with frequencies of 31.2%, 36.4%, 7% and 25.4%, respectively. Analysis of variance was performed using GLM proc of SAS software. The statistical analysis indicated that the effect of different patterns were significant on the 30-Day Bodyweight (p<0.01), but on the 60-90-150 -Day Bodyweight had no significant effect.