بررسي مولكولي و بيوانفورماتيكي ساختار ژني اينترلوكين 2 مرغ بومي خراسان

A molecular study on genetic structure of interleukin 2 in Khorasan native chicken

امروزه يكي از نگرانيهاي صنعت پرورش طيور در جهان، شيوع بيماريها در گلههاي بزرگ است. با وجود استفاده از واكسيناسيون مناسب، مصرف آنتيبيوتيك و انجام ضدعفوني در سالنهاي مرغداري، ولي همچنان شيوع بيماريها ضرر اقتصادي جبران ناپذيري را به اين صنعت وارد ميكند. يكي ديگر از راههاي مؤثر افزايش مقاومت طيور به بيماريها، بهبود ژنتيكي سيستم ايمني است كه ميتواند هزينههاي جاري مصرف واكسن و دارو را كاهش دهد. با توجه به اهميت IL-2 در سيستم ايمني، مطالعه حاضر به منظور بررسي ساختار ژن IL-2 مرغ بومي خراسان انجام گرفت. براي انجام اين تحقيق تعداد 20 نمونه DNA مرغ بومي خراسان براي تكثير و توالييابي يك قطعه 875 جفت بازي ژن IL-2 مورد استفاده قرار گرفت. مقايسه تواليهاي به دست آمده از مرغ بومي خراسان با توالي به ثبت رسيده در پايگاه دادههاي مركز ملي اطلاعات زيستفناوري وجود جهشهايي را در ژن IL-2 مرغ بومي خراسان نشان داد، به طوري كه اين جهشها در ناحيه اگزون 1 باعث تغيير اسيد آمينه شده بودند. جهشهاي اگزوني در نقاط 733، 738، 744 و 794 جفت بازي به ترتيب براي جانشيني بازهاي آدنين به جاي سيتوزين، تيمين به جاي آدنين، آدنين به جاي سيتوزين و تيمين به جاي سيتوزين بودند. وجود اين جهشها امكان استفاده از آنها به عنوان نشانگر ژني در برنامههاي انتخاب ژنومي را فراهم ميآورد كه براي تأييد آن نياز به بررسي فراواني جهشها در جمعيت و همچنين بررسي تأثير آنها بر عملكرد IL-2 از طريق آزمايشات پروتئوميكس است.

Control of diseases is one of the concerns in poultry industry worldwide. Despite the use of proper vaccines, antibiotics and sanitation in poultry farms, still disease outbreaks make irreparable economical loss. Another effective way of increasing the resistance of poultry to diseases is the genetic improvement of the immune system, which can reduce the current cost of taking vaccine and medicine. Considering the importance of IL-2 in the immune system, the present study was conducted to investigate the structure of IL-2 gene in Khorasan native chickens. To conduct this research, 20 DNA samples from Khorasan native chickens were used to amplify and sequence of 875-base pairs from the IL-2 gene. Comparison of the sequences obtained from the Khorasan native chickens with the sequence deposited in the NCBI showed mutations in the IL-2 gene, so that these mutations in the exon 1 region altered the amino acids. Exon mutations at 733, 738, 744 and 794 base pairs made to replace adenine bases instead of cytosine, thymine instead of adenine, adenine instead of cytosine, and thymine instead of cytosine. Identifying these mutations can allow them to be used as a genetic marker. To confirm this, we need to investigate the frequency of mutations and also examine their effect on IL-2 performance through proteomics experiments.