آشنايي با نرم افزار GMOseek به منظور شناسايي و بررسي موجودات تراريخته

Study of GMOseek software in order to detection of genetically modified organisms

با توجه به سرعت فزاينده تاييد و تجاري­ سازي محصولات تراريخته در سراسر جهان، آزمايش­هاي مربوط به شناسايي اين محصولات در غذا، علوفه و نمونه­ هاي بذري با توجه به مقررات مربوط، بسيار مشكل و هزينه ­بر خواهد بود. بسياري از روش­هاي تشخيصي در حال حاضر با توجه به بودجه محدود متناسب با منابع در دسترس، براي افزايش بهره­ وري از نرم­ افزارهاي مبتني بر جدول ماتريسي از داده­ ها "رويكرد ماتريسي" استفاده مي­نمايند. در بسياري از مواقع رويكرد ماتريسي با استفاده از ابزار محاسباتي خاص و اطلاعات بسيار اندك، در جهت استفاده كارآمد از داده­ هاي موجود قابل اجرا است. نرم­ افزار توسعه­ يافته GMOseek براي پشتيباني از تصميم­ گيري­هاي انجام شده در تمامي مراحل آزمايش­هاي تشخيص موجودات تراريخته، از جمله تفسير نتايج خام آزمايشگاهي طراحي شده است. اين نرم‌افزار از جدول ماتريسي رخداد (event) و عناصر ژنتيكي مربوط به آن­ها و اطلاعات موجود در مورد نمونه استفاده مي­كند. اين ابزار با استفاده از استراتژي بهينه­ سازي، روش­هاي غربالگري مناسب­تري براي نمونه پيشنهاد مي­دهد. در ادامه، نرم­ افزار GMOseek اجازه مي­دهد تا كاربر به دلخواه به جستجوي تركيب مقرون به صرفه­ اي از تست­هاي غربالگري بر روي نمونه خاص تراريخته بپردازد. بعلاوه اين نرم ­افزار به كاربر امكان انتخاب تجزيه و تحليل مناسب براي تعيين حضور يك رخداد به خصوص در نمونه مورد بررسي را مي­دهد.

Due to the increasing speed of approval and commercialization of GM crops around the world, matching tests for food, feed and seed samples according to relevant regulations will be very difficult and very expensive. Many of them have already adopted the so called “matrix approach” to rationalize the resources and efforts used to increase their efficiency within a limited budget. Most of the time, the “matrix approach” is implemented using limited information and some proprietary computational tool to efficiently use the available data. The tool makes use of a tabulated matrix of GM events and their genetic elements, of the laboratory analysis history and the available information about the sample at hand. The tool uses an optimization approach to suggest the most suited screening assays for the given sample. The practical GMOseek user interface allows the user to customize the search for a cost-efficient combination of screening assays to be employed on a given sample. It further guides the user to select appropriate analyses to determine the presence of individual GM events in the analyzed sample