بررسي تنوع ژن انترفرن گاما در گوسفندان توده شال ايران

STUDY ON INTERFERON GAMMA GENE POLYMORPHISM IN SHAUL SHEEP

انترفرن گاما سايتوكايني است كه نقش كليدي در ايمني ذاتي و اكتسابي دارد و توسط لمفوسيت‌هاي T فعال شده و سلول‌هاي كشنده طبيعي توليد مي‌شود. ژن انترفرن گاما پلي مرف است و ارتباط بين‌هاپلوتيپ‌هاي ژن مذكور در گوسفند با ايجاد حساسيت و يا مقاومت نسبت به نماتودهاي دستگاه گوارش به اثبات رسيده است. در اين مطالعه جهت ارزيابي تنوع ژن انترفرن گاما در جمعيت گوسفندان توده شال، 136 نمونه خون كامل اخذ شد. پس از استخراج DNA ژنومي، اگزون–3 ژن مذكور با كمك PCR افزوده گرديد. پس از افزوده سازي، آناليز حركت دو رشته‌اي‌هاي نامتجانس و بررسي تغييرات ساختاري تك رشته‌اي روي نمونه‌هاي افزوده شده انجام گرفت. پنج الگوي متمايز در بررسي تغييرات ساختاري تك رشته‌اي اگزون –3 ژن انترفرن گاما مشخص گرديد كه از اين تعداد سه الگو نمايانگر 3 آلل مختلف در اين جمعيت بودند. اگرچه آناليز حركت دو رشته‌اي‌هاي نامتجانس، تمام نمونه‌ها را بصورت هوموزيگوت نشان داد، ولي بررسي تغييرات ساختاري تك رشته‌اي توانست 40/4 درصد هتروزيگوتي را در جمعيت مورد مطالعه نشان دهد. نتايج اين مطالعه نشان دهنده پلي مرفيسم بالاي ژن انترفرن گاما در گوسفندان شال بود و اين گوسفندان بستري مناسب جهت ادامه مطالعات بنيادين و شناسايي رديف‌هاي نوكلئوتيدي آلل‌هاي بدست آمده خواهند بود تا درك كامل تري از ارتباط اين ژن با آلودگي به انگل‌ها و ساير عوامل بيماريزا به دست آيد.

Interferon gamma (IFN-g) is a cytokine produced by activated T lymphocytes and natural killer cells. It plays an important role in innate and adaptive immunity. IFN-g gene is polymorphic and its haplotype has been associated with resistance to nematode infestations which are the most important parasites of domestic sheep worldwide. To evaluate IFN-g polymorphism in Iranian Shaul sheep population, 136 blood samples were collected. Genomic DNA were extracted and amplified by PCR using specific primers for exon 3 of IFN-g gene. After gene amplification, SSCP and Heteroduplex mobility analysis carried out on polyacrylamid gel. Five unique SSCP patterns were detected in this population which 3 of them represent 3 alleles. Although heteroduplex mobility analysis demonstrated that all samples were homozygous, SSCP could reveal heterozygosity at frequency of 40. 4% in the studied population. Data obtained from the present study have revealed that IFN-g gene was a highly polymorphic in Iranian Shaul ecotype. This will be useful to study host-pathogen interaction and to evaluate association between resistance or susceptibility to disease with IFN-g in this ecotype.