تنوع ژنتيكي ارقام نخل خرما در استان‌هاي‌ سيستان و بلوچستان و هرمزگان با ريز ماهواره

Genetic diversity of date palm cultivars in Sistan and Baluchestan and Hormozgan provinces using microsatellite

با توجه به اهميت اقتصادي خرما، در اين پژوهش تنوع ژنتيكي 14 رقم نر و 26 رقم ماده نخل خرما با استفاده از آغازگر SSR مورد ارزيابي قرار گرفت. استخراج DNA به روش CTAB انجام شد و با استفاده از 10 جفت آغازگر SSR تكثير گرديد. محصولات تكثير شده با استفاده از ژل اكريل آميد 8% و رنگ‌آميزي با نيترات نقره مشاهده شدند. با استفاده از نرم افزار Gene Alex 6.3 نتايج مربوط به تعداد آلل مشاهده شده، هتروزيگوسيتي مشاهده شده و محتواي اطلاعات چند شكلي محاسبه شد. از روش تجزيه خوشه‌اي Nearest joining براي گروه‌بندي استفاده شد و فاصله ژنتيكي بين ارقام از طريق ضريب تشابه ني محاسبه گرديد. نتايج نشان داد كه محتواي اطلاعات چند شكلي از 63% براي آغازگر HQ542225‌ تا 85% براي آغازگر HQ542208 و با متوسط 77% متغير بود. تعداد آلل در هر جايگاه از 6 تا 9 متغير و با ميانگين 7/6 بدست آمد. از 10 جفت آغازگر مورد استفاده در مجموع 76 آلل شناسايي شد كه آغازگرهاي HQ542208 و HQ542224 با 9 آلل بيشترين و آغازگرهاي DP169 و HQ542225 با 6 آلل كمترين تعداد آلل‌ را نشان دادند. بيشترين تشابه ژنتيكي بين ارقام آلمهتري و خنيزي و كمترين ميزان تشابه بين رقم ابونارنجا و ساير ارقام بود. با توجه به يافته‌هاي حاصل از اين پژوهش، تصوير جامع‌تري از ساختار ژنتيكي ارقام نر و ماده نخل خرما بدست آمده است كه استفاده از آن‌ها را برحسب مورد در برنامه به نژادي ارقام نخل خرما ممكن مي‌سازد.

Considering the Economic importance of date palm, in this study, 14 varieties of male and 26 female cultivars of date palm were evaluated using SSR primer. DNA of young leaves of date palm was extracted by CTAB method and it was propagated by 10 pairs of SSR primers. The propagated products were observed by 8% acrylamide gel and coloring with AgNO3. Using the software Gene Alex6.3 results of alleles and observed heterozygosity and polymorphism information content were calculated. Genetic relationships among cultivars were represented by a dendrogram based on the Nei’s Genetic similarity coefficient and Nearest joining method which was considered for cluster analysis. The results showed that polymorphism information content was calculated for all pairs of primers which varied from 63% for HQ542225 to 85% for HQ542208 (mean = 77%). The number of alleles in each individual locus varied in the range of 6-9 with the mean of 7.6. The 10 primers used a total of 76 alleles were detected primers and primers HQ542208 and HQ542224 with 9 alleles most HQ542225 6 DP169 and allele showed the lowest number of alleles. The highest genetic similarity was found between Almehtary and Khanizi and the lowest one between Abonarenja and other cultivars. According to the results of this study, a more comprehensive picture of the genetic structure of male and female date palm varieties has been obtained, which makes it possible to use them according to the case study of palm date cultivars.