تفاوت دوگروه فيلوژنتيكي A و B2 سويه‌هاي اشريشيا كلي يوروپاتوژنيك از نظر توزيع ژن‌هاي حدت

The difference between two phylogenetic groups A and B2 of Uropathogenic E. coli strains in terms of distribution of virulence genes

اشريشيا كلي به عنوان فراوان‌ترين باكتري ايجاد كننده عفونت ادراري معرفي شده است. سويه‌هاي اشريشيا كلي ايجاد كننده عفونت ادراري كه به عنوان "يوروپاتوژنتيك" شناخته مي‌شوند، حاوي فاكتورهاي حدت متنوع مي‌باشند. بر اساس مطالعات قبلي سويه‌هاي متعلق به گروه فيلوژنتيكي B2 به عنوان مهم‌ترين سويه، درحالي كه سويه‌هاي گروه A به عنوان كم‌اثرترين سويه در ايجاد عفونت ادراري مطرح هستند. در اين مطالعه تعداد 100 نمونه اشريشيا كلي جدا شده از بيماران مبتلا به عفونت ادراري با روش‌هاي استاندارد بيوشيميايي تأييد شد. پس از استخراج DNA ژنومي با روش Triplex-PCR تعداد 72 سويه ( 55 سويه متعلق به گروه فيلوژنتيكي B2 و 17 نمونه متعلق به گروه A) براي تعيين ميزان توزيع ژن‌هاي حدت انتخاب شدند. فراواني ژن‌هاي cnf1،irp2 ، iha و ompT به ترتيب به ميزان 39، 29، 92 و 78 درصد مشاهده شد. ميزان فراواني اين ژن‌ها در گروه فيلوژنتيكي B2 به مراتب از گروه A بيشتر بود. تفاوت معني‌داري در ميزان توزيع ژن‌هاي cnf1 و irp2 در دو گروه فيلوژنتيكي B2 و A مشاهده شد ( 0/05 ≤P ). از نظر الگوي توزيع ژني 10 الگوي منحصر به فرد (Ec1-Ec10 ) براي اين دو گروه مشاهده شد. نتايج اين مطالعه نشان داد كه سويه‌هاي B2 حاوي ژن‌هاي حدت بيشتري نسبت به سويه‌هاي A هستند و احتمالاً نقش مهم‌تري در ايجاد عفونت ادراري دارند.

Escherichia coli is the most abundant bacterium that causes urinary tract infections. The E. coli strains that cause urinary tract infections, known as "Uropathogenic E.coli (UPEC)", contain various virulence factors. According to previous studies, the strains belonging to the phylogenetic group B2 are the most important strains, whereas strains of group A are the least effective strains for causing urinary tract infections. In this study, 100 samples of E. coli isolated from patients with urinary tract infection were confirmed by standard biochemical methods. After extraction of genomic DNA, 72 strains (55 strains belonging to phylogenetic group B2 and 17 samples belonging to group A) were selected by Triplex-PCR method to determine the distribution of virulence genes. The frequency of virulence genes cnf1, irp2, iha and ompT were observed to be 38.88%, 29.16%, 91.66% and 77.77%, respectively. The frequency of these genes in phylogenetic group B2 was significantly higher than group A. Significant difference was observed in the distribution of cnf1 and irp2 genes in both phylogenetic groups B2 and A (P≤0.05). In terms of gene distribution pattern, 10 unique patterns (Ec1-Ec10) were observed for these two groups. The results of this study showed that strains B2 contain more virulent genes than strains A and may have an important role in the development of urinary tract infections.