شناسايي ريخت‌شناختي و مولكولي برخي عامل هاي شبه قارچي ايجادكنندۀ بيماري پوسيدگي طوقه و ريشۀ درختان بادام در استان‌هاي اصفهان و چهارمحال بختياري

Morphological and molecular identification of some causal agents of root and crown rot diseases of almond in Isfahan and Chaharmahal and Bakhtiari provinces

بادام يكي از درختان ميوه تيرۀ Rosaceae است كه در استان‌هاي اصفهان و چهارمحال و بختياري براي استفاده از دانۀ خوراكي آن نسبت به ساير درختان ميوۀ هسته‌دار بيشتر كشت مي‌شود. در اين پژوهش، برخي از عاملهاي پوسيدگي ريشه و طوقۀ درختان بادام مورد بررسي قرار گرفتند. بر اساس خصوصيات مورفولوژيكي 53 جدايۀ Phytophthora cactorum ( نوزده جدايه) و Phytophthora cryptogea ( بيست و يك جدايه) و Phytopythium litorale (سيزده جدايه) جداسازي و شناسايي شدند. به‌منظور تأييد مولكولي گونه‌هاي شناسايي‌شده، تعداد 25 جدايه از بين 53 جدايۀ كل به‌طور تصادفي جهت تعيين توالي، محصول حاصل از تكثير ناحيههاي ITS انتخاب شدند. همچنين از جفت آغازگرهاي اختصاصي BPhycacL87FRG(F) /BPhycacR87RRG و Cryp1(F)/ Cryp2 براي شناسايي اختصاصي گونه‌ها استفاده شد. واكنش نهال‌هاي هشت‌ماهه رقمهاي بادام سنگي، ربيع، شاهرود 12 و پايه GF677 به سه جدايۀ (cactorum P) P1، (P. cryptogea) P32)و Pp. litorale) P41) در شرايط گلخانه نشان داد كه گونه‌هاي P. cactorum و P. cryptogea و Pp. litorale به لحاظ بيماري‌زايي تفاوت معني‌داري با يكديگر دارند. گونه‌هاي Pp. litoraleوP. cactorum به ترتيب بيشترين و كمترين بيماري‌زايي را در مقابل همۀ رقمهاي بادام داشتند و رقمهاي سنگي و GF677 به ترتيب بيشترين و كمترين حساسيت را در برابر هر سه گونه از خود نشان دادند. براي پژوهش‌هاي فيلوژنتيكي، تعداد 9 جدايه (سه جدايه از هر گونۀ P. cactorum، P. cryptogea و Pp. litorale)بر اساس توالييابي ناحيۀ ITS-rDNA بررسي شدند. اين پژوهش اولين گزارش از بيماري‌زايي Pp. litorale روي بادام در ايران است.

Almond (Prunus amygdalus L.) is a deciduous tree in the Rosaceae family and is grown mostly for its edible seed. It is one of the most popular nuts on a worldwide basis and widely grown in Iran in Isfahan and Chaharmahal and Bakhtiari provinces. Root and crown rot causal agents which are caused by several pathogens were studied. According to morphological characteristics, 53 isolates were identified as Phytopythium litorale (13 isolates), Phytophthora cactorum (19 isolates), and P. crytogea (21 isolates). Out of 53 isolates, 25 isolates were selected for molecular studies. Specific primer pairs of BPhycacL87FRG (F)/BPhycacR87RRG and Cryp1(F)/Cryp2 were used to confirm morphological identification of species. The reaction of crown and root of 8-month-old almond cultivars Sangi, Rabee, Shahrood12 and GF677 to virulent isolates of P. cactorum, P. cryptogea, and Pp. litorale was evaluated under greenhouse conditions. Comparison of pathogenicity means revealed that there are significant differences among P. cactorum, P. cryptogea, and Pp. litorale isolates. The results also showed that Pp. litorale was more aggressive than P. cactorum. On all tested almond cultivars, disease severity percentage showed that Sangi is the most susceptible cultivar and GF677 showed the least susceptibility. In this study, phylogenetic relationships of some Phytophthora and Phytopythium species based on sequencing of the rDNA-ITS region is provided. This is the first report of isolation and pathogenicity of Phytopythium litorale from almond orchards in Iran.