تعيين ويژگي‌هاي Pseudomonas syringae pv. porri عامل لكه برگي و سوختگي باكتريايي پياز دراستان‌هاي فارس و كرمانشاه

Characterization of Pseudomonas syringae pv. porri as the causal agent of bacterial leaf spot and blight of onion in Fars and Kermanshah provinces of Iran

علائم لكه برگي و سوختگي باكتريايي روي بوته‌هاي پياز Allium cepa L.، در استان ­هاي فارس (اقليد) و كرمانشاه (بيستون) با نرخ وقوع 90 تا 100 درصد روي بوته­ هاي پياز مشاهده شد. به‌منظور جداسازي و شناسايي عامل بيماري، نمونه­ هاي مشكوك از سطح مزرعه­ هاي آلوده جمع‌آوري گرديد. پس از كشت روي محيط آگار غذايي، 30 جدايه باكتريايي جداسازي شد. آزمون بيماري‌زايي جدايه ­ها روي تعدادي از گونه‌هاي Allium spp. انجام و بيماري­زايي آن­ها روي پياز، پيازچه و تره­فرنگي اثبات گرديد. اين جدايه‌ها از نظر الگوي پروتئين سلولي الكتروفورز شده به روش SDS-PAGE يكسان بودند. براساس ويژگي‌هاي فنوتيپي مانند توليد رنگدانه فلورسنت روي محيط King’B، آزمون LOPAT و استفاده از منابع كربني مختلف، جدايه­ ها به Pseudomonas syringae pv. porri شبيه بودند. همه جدايه­ ها با استفاده از BOX-PCR الگوي باندي يكساني را نشان دادند. نتايج حاصل از تكثير و توالي­يابي ژن كد كننده 16S rRNA و ژن­ هاي خانه ­داري gyrB و rpoD نشان داد كه جدايه­ هاي مورد بررسي متعلق به P. syringae pv. porri هستند. اين اولين گزارش از وجود باكتري P. syringae pv. porri در استان كرمانشاه مي ­باشد. مديريت بيماري براي جلوگيري از اپيدمي آن ضروري به‌نظر مي‌رسد.

The symptoms of bacterial leaf spot and blight on onion (Allium cepa L.) plants were observed in Fars (Eghlid) and Kermanshah (Bistoun) provinces with the rate of occurrence varying from 90 to 100% of the plants. In order to isolation and identification of the causal agent, suspicious samples were collected from infected fields. By culturing the samples on nutrient agar medium, 30 bacterial isolates were obtained. Pathogenicity test of the isolates on Allium spp. was performed and their pathogenicity was proved on onion, spring onion and leek. The isolates showed an identical total cell soluble protein pattern in SDS-PAGE. The isolates were similar to Pseudomonas syringae pv. porri based on phenotypic characteristics such as production of fluorescent pigment in KB medium, LOPAT tests, and utilization of different carbon sources. Genomic profiles generated with BOX-PCR placed the isolates into one groups. The results of the amplification and sequencing of the 16S rRNA, gyrB, and rpoD genes showed that the isolates belong to P. syringae pv. porri. This is the first report of the presence of the P. syringae pv. porri in Kermanshah province. Management of the disease seems to be necessary to prevent the disease epidemy.