متا-آناليز ترانسكريپتوم ژن هاي مسير موالونيك‌اسيد و متيل‌اريتريتول‌فسفات براي بيوسنتز ايزوپرينوئيدها در گياهان

ايزوپرينوئيدها و مشتقات آن ها بزرگترين گروه از تركيبات طبيعي در گياهان هستند كه از واحدهاي پنج كربنه ايزوپرينيل فسفات ساخته مي‌شوند. اين واحدهاي پنچ كربنه در گياهان از طريق دو مسير بيوسنتزي مجزا شامل مسير موالونات (MVA) در سيتوپلاسم و مسير متيل اريتريتول فسفات (MEP) در پلاستيد، توليد مي شوند. به منظور انجام متاآناليز ژن‌هاي دو مسير MVA و MEP از داده‌هاي بياني آزمايشات ريزآرايه در بافت هاي مختلف، مراحل نموي، تنش هاي زيستي و غيرزيستي در گياه مدل آرابيدوپسيس استفاده شد. متاآناليز ترانسكريپتوم با استفاده از ابزار Genevestigator به عنوان يك بانك اطلاعاتي بزرگ شامل داده‌هاي ترانسكريپتوم مخازن GEO در NCBI و ArrayExpress در EBI، انجام گرفت. نتايج حاصل از متاآناليز نشان داد كه به طور كلي رونويسي ژن‌هاي كد كننده آنزيم‌هاي دو مسير MVA و MEP گياهي با هم هماهنگ نيست و در بافت‌ها، مراحل رشدي و شرايط مختلف الگوي بياني متفاوتي دارند. ژن‌هاي مسير MVA بيشترين بيان را در ريشه و اندام‌هاي زايشي نشان مي‌دهند، درحالي‌كه ژن‌هاي مسير MEP بيشتر در بافت‌هاي فتوسنتزي بيان مي‌شوند. اين نتايج مي‌تواند به درك چگونگي توليد پيش سازهاي ايزوپرينوئيدها از طريق دو مسير با جايگاه متفاوت كمك كرده و همچنين سازماندهي شبكه‌هاي ژني و تنظيم آن‌ها در شرايط، بافت‌ها و مراحل نموي مختلف را آشكار مي‌سازد.