پديد آورندگان :
يوسفي دارستاني، مهديه دانشگاه تهران پرديس كشاورزي و منابع طبيعي , ميرايي آشتياني، رضا دانشگاه تهران پرديس كشاورزي و منابع طبيعي , صادقي، مصطفي دانشگاه تهران پرديس كشاورزي و منابع طبيعي
كليدواژه :
استخراج DNA از نمونۀ مو , اطلاعات چندشكلي , تنوع ژنتيكي , گاوميش , هتروزيگوسيتي
چكيده فارسي :
با توجه به اهميت حفظ تنوع در نژادهاي بومي و شناسايي ذخاير ژنتيكي كشور، تنوع ژنتيكي جمعيت گاوميش آذري با استفاده از ده نشانگر ريزماهوارهاي (BoLA-DRB3، BM1818، BM1824، CSSM033، CSSM047، ILSTS017، ILSTS033، ILSTS058، ILSTS061 و ILSTS089) بررسي شد. شمار 70 نمونه مو از گاوميش هاي آذري در سه منطقۀ شمال غربي كشور (استانهاي اردبيل، آذربايجانشرقي و آذربايجان غربي) گردآوري شد. استخراج DNA ژنگاني (ژنومي) به روش استخراج نمكي تغييريافته انجام و واكنش‌هاي زنجيرهاي پليمراز براي همۀ آغازگرها بهينه شد. نتايج نشان داد، در اين جمعيت، همۀ جايگاه ها چندشكلي بالايي داشته و افزون بر اين به‌استثناي جايگاه BoLA-DRB3، انحراف معني داري از تعادل هاردي- واينبرگ نشان دادند (P<0.001). ميانگين شمار آلل هاي مشاهده‌شده و مورد انتظار به ترتيب برابر با 5/90 و 4/72بود. افزون بر اين ميانگين ناخالصي (هتروزيگوسيتي) مشاهده‌شده و مورد انتظار، محتوي اطلاعات چندشكلي و شاخص شانون، به ترتيب برابر با 0/87، 0/75، 0/71 و 1/57بود. بنابراين، با توجه به اين نتايج، تنوع ژنتيكي بالايي در جمعيت گاوميش آذري وجود دارد.
چكيده لاتين :
Considering the importance of maintaining the diversity in native breeds and identification of genetic resources of the
country, the genetic diversity in Azari buffaloes was evaluated using ten microsatellite markers (BoLA-DRB3,
BM1818, BM1824, CSSM033, CSSM047, ILSTS017, ILSTS033, ILSTS058, ILSTS061 and ILSTS089). Hair
samples were taken from 70 Azari buffaloes from three regions of the northwest of Iran including Ardabil, East
Azerbaijan and West Azerbaijan provinces. Genomic DNA was extracted from the hair samples by the modified
salting-out method and for DNA amplification the polymerase chain reactions for all primers were optimized. The
results indicated that, in Azari buffalo population, all microsatellites loci were highly polymorphic, and they were
deviated from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.001) with an exception for BoLA-DRB3 locus. The average
observed and expected allelic numbers were 5.9 and 4.72, respectively. The observed and expected heterozygosity,
Polymorphic Information Content (PIC) and Shannon Index were 0.87, 0.75, 0.71 and 1.57, respectively. In
conclusion, the genetic variation in Azeri buffalo population is quite high and reliable.
