جداسازي و شناسايي اكتينوباكترهاي كمياب از آب‌هاي خليج فارس و درياي عمان

Isolation and Identification Rare Actinobacteria from Persian Gulf and Oman Sea

استفاده گسترده از آنتي بيوتيك ها منجر به افزايش باكتري هاي مقاوم به آنتي بيوتيك و نرخ بالاي مرگ ومير در اثر بيماري هاي عفوني شده است.pseudomonas aeruginosa يكي از مهم ترين عوامل ايجادكننده عفونت هاي بيمارستاني است كه به طيف وسيعي از آنتي بيوتيك ها مقاوم است. بنابراين يافتن منبع جديد تركيبات ضدميكروبي براي غلبه بر بيماري هاي عفوني مقاوم به آنتي بيوتيك كاملاً حياتي است. غربال گري اكتينوباكترهاي بومي راهكاري موثر به منظور يافتن تركيبات ضدميكروبي جديد است. هدف پژوهش حاضر جداسازي، غربالگري و شناسايي اكتينوباكترهاي نادر و بومي ايران به منظور يافتن سويه هاي اكتينوباكتر مولد تركيبات ضدميكروبي عليه p. aeruginosa است.مواد و روش ها: 30 نمونه آب و رسوب از خليج فارس و درياي عمان جمع آوري و براي جداسازي اكتينوباكترها در محيط مناسب كشت شد. جدايه هاي اكتينوباكتر تخليص شدند و پس از استخراج متابوليت ها، فعاليت آن ها بر عليهp. aeruginosa بررسي شد. حداقل غلظت مهاركننده رشد (mic) عصاره برتر با روش ميكرودايلوشن براث تعيين و در نهايت سويه برتر شناسايي شد.ملاحظات اخلاقي: در مطالعه حاضر، تمامي اصول ايمني زيستي و اخلاق زيستي رعايت شده است.يافته ها: 50 اكتينوباكتر از رسوبات مورد بررسي جداسازي شدند. نتايج نشان داد كه 5 جدايه داراي فعاليت ضدميكروبي قابل توجهي هستند. mic عصاره برتر عليهp. aeruginosa، 100 ميكروگرم در ميلي ليتر بود. آناليز مولكولي ژن srrna16 نشان داد كه جدايه داراي موثرترين عصاره متعلق به جنس micromonospora بوده و 99.8 درصد شباهت بهm. chalcea دارد.نتيجه گيري: اين پژوهش نشان داد كه آب هاي جنوب ايران و رسوبات موجود در آن ها منابع نويدبخشي از اكتينوباكترهاي نادر توانمند در توليد تركيبات ميكروبي عليه p. aeruginosa مي باشند.

The widespread use of antibiotics has been led to increased emergence of antibiotic resistant bacteria and high mortality and morbidity rates due to infectious diseases. Pseudomonas aeruginosa is one of the most important causes of nosocomial infections, which shows high resistance to a wide range of antibiotics. So, finding new and effective antimicrobial compounds in order to overcome antibiotic resistant infectious diseases is so critical. Screening of native actinobacteria can be an effective strategy to find novel antimicrobial compounds. The aim of current study was isolation, screening and identification of rare actinobacteria to find the strains which produce antimicrobial compounds against P. aeruginosa. Material and Methods: Thirty samples of water and sediments were collected from Persian Gulf and Oman Sea and used for isolation of actinobacterial strains. After isolation of actinobacteria, their metabolites were extracted and their anti-P. aeruginosa activities were investigated. Minimum inhibitory concentration (MIC) of the most efficient extract was determined using broth microdilution method. Finally, the most efficient strain was identified. Ethical Considerations: In this study, all principles of biosafety and bioethics have been considered. Findngs: Fifty actinobacteria were isolated from water and sediments. Five isolates had considerable antimicrobial activity. MIC value of the most efficient extract against P. aeruginosa was 100 μg/ml. Molecular analysis of 16SrRNA showed that the most effective fermentation broth extract belongs to Micromonospora and has 99.8% similarity to M. chalcea. Conclusion: The current study revealed that the water of southern Iran and their sediments are promising sources of potent rare Actinobacteria in the production of antimicrobial compounds against P. aeruginosa.